结论：个人去了乙公司但档案还在甲公司的情况下，是否可以补充乙公司的档案，这主要取决于档案管理的相关规定以及甲、乙两公司之间的具体约定或操作流程。以下从不同角度进行分析：

一、档案管理规定角度

1. 档案转移与补充：

   • 通常情况下，员工的档案会随着其工作单位的变更而转移。如果个人已经从甲公司离职并加入了乙公司，理论上其档案应该从甲公司转移至乙公司或相关的人才交流中心进行管理。
   • 如果档案尚未转移，且乙公司需要补充档案材料（如工作经历、学历证明等），这通常需要与甲公司协商，由甲公司提供相关材料或协助办理档案转移手续后，再由乙公司进行补充。

2. 档案管理的合规性：

   • 档案的管理应遵循相关法律法规和档案管理规定，确保档案的完整性、真实性和安全性。
   • 任何对档案的补充、修改或删除都应遵循规定的程序，并确保有合法的依据和记录。

二、甲、乙公司约定或操作流程角度

1. 公司间约定：

   • 如果甲、乙两公司之间有关于员工档案管理的具体约定，如档案转移的时间、方式、责任等，那么应按照这些约定来执行。
   • 在没有明确约定的情况下，双方可以协商确定档案管理的具体方式和流程。

2. 操作流程：

   • 乙公司如果需要补充档案材料，可以先与甲公司沟通，了解档案的现状和转移的可能性。
   • 如果甲公司同意提供档案材料或协助办理档案转移手续，乙公司可以按照规定的程序进行档案的补充。
   • 如果甲公司不同意或无法提供档案材料，乙公司可能需要考虑其他方式来获取所需材料，如要求员工个人提供、通过其他渠道查询等。

三、实际操作建议

1. 与甲公司沟通：

   • 首先，建议与甲公司的人力资源部门或档案管理部门沟通，了解档案的现状和转移的可能性。
   • 询问甲公司是否愿意提供档案材料或协助办理档案转移手续。

2. 与乙公司协商：

   • 同时，与乙公司的人力资源部门或档案管理部门协商，了解乙公司对档案补充的具体要求和流程。
   • 确定乙公司是否接受由甲公司提供的档案材料或是否需要其他形式的证明。

3. 遵循规定程序：

   • 在进行档案补充时，务必遵循相关的法律法规和档案管理规定。
   • 确保所有操作都有合法的依据和记录，以避免后续可能出现的法律纠纷。

总结与进一步行动建议：个人在去了乙公司但档案还在甲公司的情况下，是否可以补充乙公司的档案，需要综合考虑档案管理规定以及甲、乙两公司之间的具体约定或操作流程。建议先与甲、乙两公司沟通协商，了解档案的现状和转移的可能性，以及乙公司对档案补充的具体要求和流程。如有需要，可以寻求专业的档案管理机构或法律人士的帮助，以确保档案管理的合规性和有效性。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。