核心结论：合作商丢失加工商货物且数量、金额价值均大的情况下，加工商可通过协商、民事诉讼、刑事报案（若涉嫌犯罪）等途径维护自身权益，具体如下：

1. 协商解决

   • 前提与操作：在发现货物丢失后，加工商首先应尽快与合作商取得联系，以友好、理性的态度进行沟通协商。向合作商详细说明货物丢失给自己造成的损失情况，包括货物的成本价值、因货物丢失可能导致的生产延误损失、预期利润损失等。要求合作商积极采取措施查找货物，如确实无法找回，则应就赔偿事宜进行协商。
   • 优势：协商解决成本较低，能够快速达成双方都能接受的解决方案，避免长时间的法律纠纷，有利于维护双方长期的合作关系。
   • 风险：如果合作商态度消极，不配合协商或者拒绝承担赔偿责任，那么协商可能无法达到预期效果，此时加工商需要考虑其他法律途径。

2. 民事诉讼

   • 前提与操作：若协商无果，加工商可以依据双方之间的合同关系或者相关法律规定，向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。需要准备充分的证据材料，如合同、货物交付凭证、货物价值证明（如发票、采购合同等）、货物丢失的相关证据（如监控录像、物流记录等）以及因货物丢失造成的损失计算依据等。在诉讼过程中，要明确诉讼请求，如要求合作商赔偿货物损失、因货物丢失导致的其他直接和间接损失等。
   • 优势：通过法院的公正审判，能够依法确定合作商的责任和赔偿金额，具有强制执行力。一旦法院作出判决，如果合作商不履行判决义务，加工商可以申请法院强制执行。
   • 风险：民事诉讼程序相对复杂，需要耗费一定的时间、精力和费用。而且诉讼结果存在一定的不确定性，如果证据不充分或者法律适用不当，可能无法获得理想的赔偿结果。

3. 刑事报案（若涉嫌犯罪）

   • 前提与操作：如果合作商在货物丢失过程中存在故意侵占、盗窃等涉嫌犯罪的行为，加工商可以向公安机关报案。公安机关会依法进行调查取证，如果认定合作商的行为构成犯罪，会依法追究其刑事责任。在刑事诉讼过程中，加工商可以作为被害人参与诉讼，提出附带民事诉讼，要求合作商赔偿经济损失。
   • 优势：如果合作商的行为构成犯罪，通过刑事报案可以使其受到法律的严厉制裁，起到震慑作用。同时，在附带民事诉讼中，加工商有机会获得较为全面的赔偿。
   • 风险：刑事报案需要有一定的证据证明合作商存在犯罪行为，如果证据不足，公安机关可能不予立案。而且刑事诉讼程序较为严格，时间跨度可能较长。

在处理此类问题时，加工商要根据具体情况选择合适的途径，并注意收集和保存相关证据，以维护自身的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。