结论前置：交通事故双方达成协议后，事故认定书（您所称的“事故判据书”应为事故认定书）的发放与否并不受双方协议的影响，事故认定书仍会依法发放。以下从多个角度为您详细分析：

一、事故认定书的法律性质与作用

事故认定书是公安机关交通管理部门根据交通事故现场勘查、调查取证、检验鉴定等证据，依法作出的责任认定文书。它不仅是交通事故处理的重要依据，也是后续赔偿、调解、诉讼等环节的关键证据。事故认定书具有客观性、公正性和权威性，其内容对交通事故双方及保险公司等第三方均具有约束力。

二、双方达成协议与事故认定书发放的关系

1. 协议不影响事故认定书的发放：交通事故双方达成协议，是双方对事故赔偿等事宜的自愿协商和妥协，这并不影响公安机关交通管理部门依法作出事故认定书。事故认定书的发放是基于交通事故的客观事实和法律规定，与双方是否达成协议无关。

2. 协议内容可能受事故认定书影响：虽然双方达成协议不影响事故认定书的发放，但协议的内容（如赔偿金额、责任分担等）往往受到事故认定书的影响。事故认定书确定了双方的责任比例，为双方协商提供了基础和依据。

三、事故认定书发放后的处理

1. 协议与事故认定书一致的情况：如果双方达成的协议与事故认定书确定的责任比例和赔偿金额等一致，那么双方可以按照协议履行，无需再对事故认定书提出异议。

2. 协议与事故认定书不一致的情况：如果双方达成的协议与事故认定书确定的内容不一致，特别是责任比例和赔偿金额等关键条款存在差异，那么双方需要谨慎考虑。一方面，如果协议内容违反了法律法规的强制性规定或公序良俗，那么该协议可能无效或部分无效；另一方面，如果协议内容虽然与事故认定书不一致，但双方均自愿接受并愿意履行，那么该协议在双方之间仍然具有约束力。然而，在后续可能涉及的诉讼等法律程序中，事故认定书作为官方证据，其证明力通常高于双方自行达成的协议。

四、建议与提醒

1. 重视事故认定书的作用：无论双方是否达成协议，都应重视事故认定书的作用。在收到事故认定书后，应认真核对内容是否准确无误，如有异议应及时提出复核申请。

2. 谨慎签订协议：在签订协议前，应充分了解事故认定书的内容和责任比例，确保协议内容合法合规且符合自身利益。如有需要，可以咨询专业律师的意见。

3. 保留相关证据：在处理交通事故过程中，应妥善保管好相关证据（如现场照片、视频、证人证言等），以便在后续可能涉及的调解、诉讼等环节中提供有力支持。

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