公司确实有可能通过其他方式发放加班工资，但这些方式必须符合法律法规的规定。以下从几个角度详细分析：
一、合法合规的其他发放方式
实物或福利形式：
- 根据《劳动法》及相关规定，加班工资原则上应以货币形式支付。但在某些特殊情况下，如果公司与员工协商一致，且实物或福利的价值能够合理折算为加班工资，并符合税务等相关规定，理论上可以作为加班工资的补充形式。不过，这种方式较为少见，且需严格遵守法律法规，避免引发纠纷。
调休替代：
- 对于非法定节假日的加班，公司可以选择安排员工调休来替代支付加班工资。根据《劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这意味着，如果公司能够安排员工在后续的工作日内进行调休，那么就不需要支付额外的加班工资。但需要注意的是，法定节假日的加班不能通过调休来替代，必须支付加班工资。
通过工资结构调整：
- 公司可以在与员工协商一致的情况下，对工资结构进行调整，将部分工资作为加班工资的预支或包含在内。但这种方式需要确保员工的总工资水平不低于当地最低工资标准，且加班工资的支付符合法律法规的规定。例如，公司可以与员工约定，将每月工资中的一部分作为固定加班工资，用于支付员工可能产生的加班费用。但这种方式需要明确约定，并确保员工的知情权。
二、非法或不规范的发放方式
隐瞒或虚假记录：
- 公司如果通过隐瞒加班事实或虚假记录考勤的方式来避免支付加班工资，这是违法的。员工有权要求公司支付应得的加班工资，并可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
以其他名义支付：
- 公司如果将加班工资以其他名义（如奖金、津贴等）支付给员工，但未明确告知员工这是加班工资，且未按照法律法规规定的标准支付，这也可能构成违法行为。员工有权要求公司明确加班工资的支付方式和标准。
三、法律建议
明确约定：
- 公司与员工在签订劳动合同时，应明确约定加班工资的支付方式、标准和时间等事项。这有助于避免后续纠纷的发生。
遵守法律法规：
- 公司在支付加班工资时，必须严格遵守《劳动法》及相关法律法规的规定。不得以任何形式逃避或减少加班工资的支付义务。
保留证据：
- 员工在加班时，应保留好相关证据（如考勤记录、加班通知等），以便在需要时证明自己的加班事实和应得的加班工资。
如果你对公司发放加班工资的方式有疑问或发现公司存在违法行为，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。