劳动者在特定情况下可以向法院起诉工程承包单位承担用工主体责任。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律依据

根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》等相关法律法规，工程承包单位在特定情况下需要承担用工主体责任。例如，当工程承包单位将工程违法转包、分包给不具备用工主体资格的组织或个人，且该组织或个人招用的劳动者在从事承包业务时因工伤亡时，工程承包单位就需要承担用工主体责任。

二、具体情况分析

1. 工程承包单位违法转包、分包：

   • 如果工程承包单位将工程违法转包、分包给不具备用工主体资格的组织或个人，并且该组织或个人招用的劳动者在从事承包业务时发生工伤，那么劳动者可以向法院起诉工程承包单位，要求其承担用工主体责任。

2. 劳动者与工程承包单位存在事实劳动关系：

   • 在某些情况下，虽然劳动者没有与工程承包单位签订书面劳动合同，但如果双方存在事实劳动关系，并且劳动者在工作过程中发生工伤，那么劳动者同样可以向法院起诉工程承包单位，要求其承担用工主体责任。

三、法律建议

1. 收集证据：

   • 劳动者在起诉工程承包单位之前，应尽可能收集相关证据，如劳动合同、工资支付记录、工作证明、工伤认定决定书等，以证明自己与工程承包单位之间的劳动关系以及工伤事实。

2. 咨询专业律师：

   • 劳动者在起诉前可以咨询专业律师，了解具体的法律程序和诉讼策略，以确保自己的权益得到有效维护。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和指导。

3. 及时起诉：

   • 劳动者应在法律规定的时效期内向法院提起诉讼，以免因超过时效期而丧失诉讼权利。

综上所述，劳动者在特定情况下可以向法院起诉工程承包单位承担用工主体责任。在起诉前，劳动者应收集相关证据并咨询专业律师以确保自己的权益得到有效维护。