关于只和部分被拆除房屋使用人签订的协议是否有效的问题，这并非一个简单的“有效”或“无效”的二元判断，而是需要结合具体情况进行深入分析。以下是从不同角度对此问题的详细解答：

1. 协议主体与房屋产权的关系：

   • 产权明晰且协议主体为产权人：如果房屋产权明晰，且签订协议的主体是房屋的合法产权人，那么该协议在双方自愿、平等、公平的基础上签订，且内容不违反法律法规的强制性规定，通常是有效的。但此处需注意，若房屋为共有产权，仅与部分共有人签订协议可能涉及对其他共有人权益的侵害，此时协议的效力可能受到质疑。
   • 产权不明或存在争议：若房屋产权不明或存在争议，如存在多个使用人且产权归属未明确，此时仅与部分使用人签订协议，可能因涉及第三方权益而引发纠纷，协议的效力可能受到挑战。

2. 协议内容与法律法规的符合性：

   • 符合法律法规：协议内容若符合相关法律法规的规定，如拆迁补偿、房屋买卖等，且未侵犯国家、集体或第三人的合法权益，那么该协议在法律上通常是有效的。
   • 违反法律法规：若协议内容违反法律法规的强制性规定，如涉及非法买卖、欺诈等，那么该协议自始无效，不受法律保护。

3. 协议签订过程中的程序合法性：

   • 程序合法：协议签订过程中，若双方遵循了自愿、平等、公平的原则，且进行了充分的协商和沟通，同时履行了必要的法律手续（如签字、盖章等），那么该协议在程序上通常是合法的，具有法律效力。
   • 程序违法：若协议签订过程中存在欺诈、胁迫、恶意串通等违法行为，或者未履行必要的法律手续，那么该协议可能因程序违法而无效。

4. 对其他使用人的影响：

   • 未侵害其他使用人权益：若协议签订未侵害其他房屋使用人的合法权益，如未侵犯他们的居住权、使用权等，那么该协议在法律上通常不会受到其他使用人的挑战。
   • 侵害其他使用人权益：若协议签订侵害了其他房屋使用人的合法权益，如未经他们同意擅自处分共有财产等，那么该协议可能因侵害第三方权益而无效或部分无效。

法律建议：

• 在签订涉及房屋产权的协议时，务必确保协议主体具有合法的产权或使用权，且协议内容符合法律法规的规定。
• 若房屋存在共有产权或多个使用人，应确保所有相关方都参与协议的签订，或至少获得他们的明确同意，以避免后续纠纷。
• 在签订协议前，建议咨询专业律师，对协议内容进行法律审查，确保协议的合法性和有效性。

可能后果：

• 若协议有效，双方应按照协议约定履行各自义务，否则可能承担违约责任。
• 若协议无效或部分无效，双方可能因协议内容产生纠纷，甚至需要通过法律途径解决争议。

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