保证金扣除的权力归属，主要取决于招标文件或相关合同的约定，但通常情况下，这一权力属于招标人。以下是对此问题的详细分析：

1. 招标文件或合同约定：

   • 在建设工程招标过程中，招标文件通常会明确规定保证金的缴纳、退还及扣除等条款。这些条款是招标人和投标人之间权利义务的重要依据。
   • 如果招标文件或相关合同中明确规定了保证金扣除的权力属于招标人，那么招标人就有权在特定情况下扣除投标人的保证金。
   • 反之，如果招标文件或合同中未明确规定或规定不明确，则需要根据相关法律法规和行业惯例进行判断。

2. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关法律法规，招标人有权在投标人违反招标文件规定或合同约定时，采取相应的措施，包括扣除保证金。
   • 保证金作为投标人履行招标文件规定义务的一种担保方式，其扣除通常与投标人的违约行为相关联。因此，在投标人违约的情况下，招标人有权扣除保证金以弥补其损失。

3. 代理机构角色：

   • 代理机构在招标过程中通常扮演组织、协调、监督等角色，负责招标文件的编制、发布、开标、评标等工作。
   • 除非招标文件或相关合同中明确赋予代理机构扣除保证金的权力，否则代理机构通常无权直接扣除投标人的保证金。代理机构的行为应严格遵循招标人的指示和招标文件的规定。

4. 实际操作建议：

   • 对于投标人而言，应仔细阅读招标文件和相关合同，了解保证金的缴纳、退还及扣除等条款，以避免因不了解规定而遭受损失。
   • 对于招标人而言，应在招标文件中明确规定保证金的扣除条件和程序，以确保在投标人违约时能够依法、合规地扣除保证金。
   • 在实际操作中，如果发生保证金扣除的争议，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。

总结来说，保证金扣除的权力通常属于招标人，但具体应根据招标文件或相关合同的约定来确定。在招标过程中，双方应明确各自的权利义务，以避免因保证金扣除等问题产生争议。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。