即使店铺倒闭，劳动者依然有权申请劳动仲裁以维护自身合法权益。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律依据与仲裁主体
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，中华人民共和国境内的用人单位与劳动者之间因确认劳动关系、劳动报酬、经济补偿等发生的争议，均适用本法。店铺倒闭并不免除其作为用人单位的法律责任，劳动者仍有权就上述争议申请劳动仲裁。
仲裁主体：
- 若店铺倒闭但未注销，劳动者应以该店铺为被申请人申请仲裁。
- 若店铺已注销，则需根据具体情况确定责任承担主体。例如，若股东未履行清算义务，可列其为被申请人；若店铺合并或分立，则合并或分立后的企业作为被申请人。
二、仲裁前的准备工作
收集证据：
- 劳动者应收集与劳动关系及权益受损相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录、工作证、同事证言等。这些证据将有助于证明劳动关系的存在以及权益受损的事实。
准备申请材料：
- 劳动者需准备仲裁申请书，详细写明申请人（劳动者）和被申请人（店铺或相关责任主体）的基本信息、仲裁请求（如支付拖欠工资、经济补偿金等）以及事实和理由。
- 同时，需提交身份证明（如身份证原件及复印件）和证据材料（一式多份，根据被申请人数量和仲裁委要求确定份数）。
三、仲裁流程与裁决
提交仲裁申请：
- 劳动者应向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。仲裁委员会将在五日内审查申请材料，符合受理条件的予以受理，并出具受理通知书；不符合的书面通知不予受理并说明理由。
开庭审理：
- 仲裁庭将提前通知开庭时间、地点。双方当事人需准时出席，陈述、举证、质证、辩论。仲裁员将调查询问，并根据双方陈述和证据进行审理。
作出裁决：
- 仲裁庭在审理后，将尝试调解。若调解成功，将制作调解书，经双方签收后生效；若调解不成，将在规定时间内作出裁决，并向双方送达仲裁裁决书。裁决书一经送达即发生法律效力。
四、裁决后的执行与权益保障
强制执行：
- 若劳动者胜诉且店铺或相关责任主体未在规定时间内履行裁决义务，劳动者可在期限届满后向法院申请强制执行。法院有权采取查询、冻结、扣划财产等措施，以保障劳动者的合法权益。
员工权益保障：
- 根据《劳动合同法》和《破产法》的相关规定，即使店铺倒闭，员工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用以及基本养老保险、基本医疗保险费用等仍优先清偿。这意味着在破产清算程序中，员工的这些权益将得到优先保障。
五、特殊注意事项
- 仲裁时效：劳动者应在知道或应当知道自己的权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁，以免超过时效而丧失维权机会。
- 材料真实性：在整个仲裁过程中，劳动者应确保所有材料的真实性和完整性。任何虚假陈述或伪造证据的行为都可能导致仲裁失败或承担法律责任。
- 关注程序进展：劳动者应密切关注仲裁程序的进展，及时响应仲裁庭的要求和通知。如有正当理由无法出席庭审，应提前向仲裁庭申请延期。
综上所述，即使店铺倒闭，劳动者依然有权通过劳动仲裁来维护自己的合法权益。在实际操作中，建议您根据具体情况准备充分的证据材料，并按照法定流程进行仲裁申请。如果您在仲裁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。