协商解除劳动合同让员工提出申请时，经济补偿的支付主要取决于用人单位是否存在过错以及双方是否协商一致，具体分为以下几种情况：
用人单位存在过错
- 情形说明：若用人单位存在未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费、规章制度违反法律法规损害劳动者权益等过错情形，劳动者有权提出解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。
- 经济补偿计算：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
用人单位无过错，但双方协商一致且约定支付经济补偿
- 情形说明：若用人单位无上述过错情形，但劳动者提出解除劳动合同后，双方经过协商，明确约定了解除劳动合同并支付经济补偿金，那么用人单位应当根据协商结果和工作年限来支付相应的经济补偿。
- 经济补偿计算：同样按照上述工作年限和月工资的标准进行计算。
用人单位无过错，且劳动者因个人原因主动离职
- 情形说明：若用人单位不存在过错，且劳动者因个人原因（如个人发展规划、家庭因素等）主动提出解除劳动合同，如提前三十日以书面形式通知用人单位或在试用期内提前三日通知用人单位，这种情况下用人单位无需向劳动者支付经济补偿。
实际操作建议：
- 在协商解除劳动合同的过程中，双方应明确解除合同的条件、经济补偿的金额及支付方式等关键要素，并达成一致性共识。
- 劳动者在提出解除劳动合同前，应仔细审查自身情况，确认是否符合获得经济补偿的条件，并收集相关证据，如工资单、社保缴纳记录、劳动合同等，以证明解除合同的原因和自身权益。
- 若双方无法就经济补偿等问题达成一致，劳动者可通过法律途径维护自身合法权益，如向劳动仲裁委员会申请仲裁或向法院提起诉讼。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条：用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条：有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：（一）劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的；（二）用人单位依照本法第三十六条规定向劳动者提出解除劳动合同并与劳动者协商一致解除劳动合同的……（此处仅列举与问题直接相关的条款，其他条款略）。
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