结论：不是同一个集体经济组织的成员之间，一方将互换的自留地擅自转给第三方，这一行为是否合理，需根据具体情况判断，一般情况下，若未经原自留地使用权人同意擅自转让，该行为是不合理的，且可能涉及违法。以下从几个角度进行分析：
一、自留地的性质与互换协议的效力
自留地是中国农村集体经济组织按政策规定分配给成员长期使用的土地，用于种植农作物，其使用权受法律保护。若双方属于同一集体经济组织成员，且互换自留地的行为符合法律规定（如签订书面协议、经过集体经济组织同意等），则互换行为有效，双方均应遵守协议约定。然而，若双方并非同一集体经济组织成员，互换自留地的行为可能因违反相关规定而无效，因为自留地的分配和使用通常受到集体经济组织成员身份的限制。
二、擅自转让行为的合法性
若互换协议有效：即便双方互换自留地的行为有效，一方在未经另一方同意的情况下，擅自将互换后的自留地转让给第三方，也构成违约行为。原自留地使用权人有权要求违约方承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、恢复原状等。
若互换协议无效：若双方互换自留地的行为因违反相关规定而无效，则一方擅自转让自留地的行为更是缺乏法律依据。此时，原自留地使用权人不仅有权要求违约方承担违约责任（尽管协议无效，但违约方仍可能因过错而需承担赔偿责任），还有权要求返还自留地或恢复原状。
三、第三方权益的保护
在擅自转让自留地的情况下，第三方的权益保护也是一个重要问题。若第三方在受让自留地时不知情且支付了合理对价，可能构成善意取得。然而，由于自留地的特殊性（如使用权受限、需集体经济组织成员身份等），第三方能否真正取得自留地的使用权仍需根据具体情况判断。若第三方明知或应知转让行为存在瑕疵（如未经原自留地使用权人同意、互换协议无效等），则其权益可能不受法律保护。
四、法律建议
对于原自留地使用权人：若发现对方擅自转让互换后的自留地，应及时收集证据（如互换协议、转让协议、支付凭证等），并向法院提起诉讼，要求违约方承担违约责任或返还自留地。
对于第三方：在受让自留地前，应充分了解自留地的性质、使用权状况以及转让方的身份和权限等信息，确保受让行为的合法性。若因受让行为产生纠纷，应及时咨询专业律师，维护自身合法权益。
对于双方：在互换自留地前，应签订书面协议并明确约定双方的权利义务、违约责任等内容。同时，应确保互换行为符合相关规定（如经过集体经济组织同意等），以避免后续纠纷的发生。
总结来说，不是同一个集体经济组织的成员之间互换自留地并擅自转让给第三方的行为，在大多数情况下是不合理的且可能涉及违法。双方应严格遵守法律规定和协议约定，确保互换和转让行为的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。