结论：农村宅基地旁边的菜地被村集体改作化粪池是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及土地性质、规划用途、审批程序及是否侵犯相邻权等多个方面。以下从不同角度进行分析：
一、土地性质与规划用途
土地性质：
- 若菜地属于宅基地的一部分或与宅基地紧密相连，且宅基地使用权已依法取得，则村集体未经合法程序不得擅自改变其用途。
- 若菜地属于村集体所有的其他土地（如耕地、未利用地等），则村集体在符合规划用途的前提下，有权进行合理利用，但需遵循相关法律法规和程序。
规划用途：
- 根据《土地管理法》等相关法律法规，土地用途需符合土地利用总体规划和城乡规划。若将菜地改作化粪池不符合规划用途，则可能构成违法。
- 村集体在改变土地用途前，应依法办理相关审批手续，确保改造行为合法合规。
二、审批程序
审批要求：
- 村集体在改变土地用途或进行建设活动前，需依法向相关部门提出申请，并获得批准。未经批准擅自改变土地用途或进行建设活动的，可能面临行政处罚。
- 审批过程中，相关部门会综合考虑土地性质、规划用途、环境影响、相邻关系等因素，确保改造行为符合法律法规和公共利益。
村民权益保护：
- 在审批过程中，应充分听取村民意见，保障村民的知情权、参与权和监督权。若村民对改造行为有异议，可通过合法途径表达诉求。
三、相邻权保护
相邻权定义：
- 相邻权是指不动产的相邻各方在行使所有权或使用权时，因相互间依法应给予方便或接受限制而发生的权利义务关系。
相邻权保护原则：
- 在改造过程中，村集体应尊重相邻村民的合法权益，不得侵犯其相邻权。如因改造行为导致相邻村民的生产生活受到影响的，应依法承担赔偿责任。
- 若改造行为可能对相邻村民造成不利影响（如噪音、异味、污染等），村集体应采取有效措施进行防范和治理，确保相邻村民的合法权益不受侵害。
四、具体建议
核实土地性质和规划用途：
- 村民可向当地土地管理部门或规划部门查询相关土地的性质和规划用途，以确定改造行为是否合法合规。
了解审批程序：
- 村民可要求村集体出示相关审批文件，了解改造行为是否已获得合法批准。若未获得批准或审批程序存在瑕疵，村民可向相关部门举报或投诉。
维护相邻权：
- 若改造行为对村民的相邻权造成侵害，村民可依法要求村集体停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。在协商无果的情况下，村民可向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
总结：农村宅基地旁边的菜地被村集体改作化粪池是否合法，需根据土地性质、规划用途、审批程序及是否侵犯相邻权等多个方面进行综合判断。若村民对改造行为有异议或认为自己的合法权益受到侵害，可依法采取相应措施进行维权。如有具体法律问题，可直接向我咨询。