在员工被认定为工伤的情况下，单位应按照《工伤保险条例》的规定，在停工留薪期内按月支付员工原工资福利待遇，而不是单纯按照单位内部文件规定发放。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与基本原则

根据《工伤保险条例》第三十三条的明确规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这一规定是强制性的，单位必须遵守，不能仅凭内部文件规定来改变这一原则。

二、停工留薪期的确定与工资发放

1. 停工留薪期：通常不超过12个月，自职工受伤之日起计算。若伤情严重或情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可适当延长，但延长期限同样不得超过12个月。因此，最长可享受的停工留薪期待遇为24个月。

2. 工资发放：在停工留薪期内，单位应按月支付职工原工资福利待遇，这一待遇不变。这里的“原工资福利待遇”指的是工伤职工在本单位受工伤前十二个月的平均工资福利待遇，包括但不限于计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等所有货币性收入。

三、单位内部文件与法律规定的关系

1. 单位内部文件不能违反法律规定：虽然单位可以制定内部规章制度，但这些规章制度不能违反国家法律法规的强制性规定。在工伤工资发放问题上，单位必须遵守《工伤保险条例》的规定，不能仅凭内部文件来降低或改变工伤职工的工资待遇。

2. 单位内部文件可作为补充：如果单位内部文件在遵守国家法律法规的前提下，对工伤工资发放等细节问题进行了更详细的规定，那么这些规定可以作为对法律法规的补充，但前提是不得与法律法规相抵触。

四、特殊情况处理与建议

1. 单位不依法发放工资：若用人单位未按规定支付工伤职工停工留薪期工资，职工首先应与单位协商解决；协商不成时，可以通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自身权益。

2. 实际操作建议：

   • 及时申报工伤：职工发生工伤后，应尽快向单位报告并申请工伤认定，以确保自身权益得到及时保护。
   • 保留证据材料：职工应妥善保存与工伤相关的所有证据材料，如医疗记录、工伤认定书、工资单等，以备不时之需。
   • 有问题直接咨询：在遇到单位不支付工资或其他争议时，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。

综上所述，工伤期间单位应当按月支付职工原工资福利待遇，这是法律规定的明确义务。单位内部文件不能违反这一规定，只能作为补充。职工应了解自身权益，并在必要时采取合法手段维护自身利益。