结论前置：员工贪污公司财物后，公司已对其进行罚款，但这并不影响公司后续通过法律途径追究其刑事责任或要求其承担民事赔偿责任。罚款与刑事责任、民事赔偿是三种不同的法律责任，它们之间并不互相排斥。

详细分析：

1. 罚款与刑事责任的关系：

   • 罚款：通常是公司内部对员工违规行为的一种经济处罚，属于公司自治范畴，但需注意，公司并无行政处罚权，其“罚款”行为在法律上可能被视为一种违约金或赔偿金的性质，且需符合公司章程和劳动合同的约定，否则可能引发劳动争议。
   • 刑事责任：当员工的贪污行为达到刑法规定的犯罪标准时，即构成贪污罪或其他相关犯罪，公司可以向公安机关报案，由司法机关依法追究其刑事责任。刑事责任的追究不受公司是否已对员工进行罚款的影响。

2. 罚款与民事赔偿的关系：

   • 民事赔偿：员工贪污公司财物，给公司造成经济损失的，公司有权要求员工承担民事赔偿责任，赔偿因其贪污行为给公司造成的直接经济损失。
   • 罚款与赔偿的并存：公司对员工进行罚款，并不意味着员工就无需再承担民事赔偿责任。罚款和赔偿是两种不同的法律责任，罚款是公司对员工违规行为的惩罚，而赔偿是对公司经济损失的补偿。因此，即使公司已对员工进行罚款，员工仍需根据其贪污行为给公司造成的实际损失，承担相应的民事赔偿责任。

3. 法律程序与建议：

   • 刑事报案：如果公司认为员工的贪污行为已构成犯罪，应及时向公安机关报案，并提供相关证据材料，以便司法机关依法追究其刑事责任。
   • 民事诉讼：对于员工贪污行为给公司造成的经济损失，公司可以通过民事诉讼的方式，要求员工承担赔偿责任。在诉讼过程中，公司需提供充分的证据证明其经济损失的具体数额和员工贪污行为之间的因果关系。
   • 内部处理与法律程序的衔接：公司在对员工进行内部处理（如罚款、辞退等）时，应注意保留相关证据材料，以便在后续的法律程序中使用。同时，公司也应确保内部处理程序符合法律法规和公司章程的规定，避免因处理不当而引发新的法律纠纷。

特殊情况说明：

• 如果员工贪污的金额较小，未达到刑法规定的犯罪标准，那么公司可能无法通过刑事途径追究其责任，但仍可以通过民事诉讼的方式要求其承担赔偿责任。
• 如果公司对员工的罚款行为本身存在违法情形（如罚款金额过高、罚款程序不合法等），那么员工有权依法维护自己的合法权益，包括向劳动争议仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

总结与建议： 员工贪污公司财物后，公司已对其进行罚款，并不影响公司后续通过法律途径追究其刑事责任或要求其承担民事赔偿责任。公司应根据实际情况，选择合适的法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。