在合伙公司股东存在纠纷，且其他股东不愿意的情况下，公司是否还能继续经营，这主要取决于纠纷的具体性质、公司章程的规定以及相关法律法规的适用。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
纠纷性质与影响：
- 内部管理纠纷：如果纠纷主要涉及公司内部管理、决策权分配或股东间的利益分配等问题，且未直接影响到公司的外部经营和合同履行，那么公司通常仍可以继续经营。但这种情况下，股东间的矛盾可能会影响公司的决策效率和运营稳定性，长期下去可能对公司造成不利影响。
- 严重违法或违规行为：如果纠纷涉及股东或公司高管的严重违法或违规行为，如挪用资金、欺诈等，这可能直接导致公司面临法律诉讼、行政处罚甚至被吊销营业执照等严重后果。在这种情况下，公司的继续经营将受到严重威胁。
公司章程的规定：
- 公司章程是公司治理的基本法律文件，其中可能包含关于股东纠纷解决机制、公司经营决策程序等条款。如果公司章程对股东纠纷有明确的解决机制（如仲裁、调解等），且该机制能够得到有效执行，那么公司可能能够在纠纷解决的同时继续经营。
- 如果公司章程未对股东纠纷作出明确规定，或者规定无法得到有效执行，那么股东间的纠纷可能更加难以解决，进而影响公司的正常经营。
相关法律法规的适用：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，股东之间应当遵循诚实信用原则，依法行使股东权利，履行股东义务。如果股东间的纠纷违反了法律法规或公司章程的规定，那么相关股东可能需要承担法律责任。
- 在股东纠纷导致公司无法正常经营的情况下，其他股东或公司债权人可以依法向人民法院提起诉讼，要求解散公司或采取其他法律措施保护自身权益。然而，这并不意味着公司必须立即停止经营，而是需要根据具体情况和法院的判决来决定。
法律建议：
- 协商解决：首先，建议股东间通过协商、调解等方式解决纠纷，以维护公司的稳定和持续经营。这有助于减少法律成本和时间成本，同时保持公司的商业信誉和客户关系。
- 寻求专业帮助：如果协商无果，股东可以寻求专业律师或调解机构的帮助，以更有效地解决纠纷。律师可以提供法律意见和调解方案，帮助股东达成和解协议。
- 依法维权：在纠纷无法通过协商解决的情况下，股东可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自身权益。但在此过程中，应注意保留相关证据和文件，以便在法律程序中证明自己的主张。
可能后果：
- 如果股东间的纠纷长期得不到解决，可能导致公司决策瘫痪、运营受阻甚至破产清算等严重后果。这不仅会影响股东自身的利益，还可能对公司的员工、客户和供应商等利益相关者造成不利影响。
因此，在合伙公司股东存在纠纷的情况下，其他股东不愿意并不意味着公司必须停止经营。但股东应尽快通过协商、调解或法律途径解决纠纷，以维护公司的稳定和持续经营。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。