刑事诉讼第一百六十三条规定的撤案情形主要包括以下几种：
情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的：
- 当行为人的行为虽然表面符合犯罪构成要件，但综合考虑情节极为轻微，对社会危害极小，依法不应当认定为犯罪时，案件可撤销。例如，小额盗窃初犯，若情节显著轻微，可能因此被撤销案件。这一规定体现了刑法的谦抑性原则，即对于轻微违法行为，尽量不通过刑事手段进行处罚。
犯罪已过追诉时效期限的：
- 刑法为各类犯罪设定了追诉时效期限，超过该期限，司法机关即不再追究刑事责任。如法定最高刑不满五年有期徒刑的犯罪，经过五年后便不再追诉。若犯罪嫌疑人所犯之罪已超过追诉时效，侦查机关应依法撤案。这一规定旨在确保刑事追诉的及时性和有效性，避免对已经失去社会危害性的犯罪行为进行不必要的追诉。
经特赦令免除刑罚的：
- 特赦是国家对特定犯罪分子免除其全部或部分刑罚的制度。特赦仅免除刑罚执行，并不改变犯罪事实的存在。若某犯罪嫌疑人的罪行属于特赦范围，侦查机关应撤销案件。特赦令通常由全国人民代表大会常务委员会决定，国家主席发布，体现了国家对特定犯罪分子的宽大处理。
依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的：
- 告诉才处理的犯罪包括侮辱罪、诽谤罪（除严重危害社会秩序和国家利益外）、暴力干涉婚姻自由罪（除致使被害人死亡外）、虐待罪（除致使被害人重伤、死亡外）、侵占罪等。这类犯罪需被害人主动向法院提出告诉。若被害人未提起告诉或提起后撤回，侦查机关应撤案。例如，侮辱案件中，若被害人考虑后决定撤回告诉，则案件应予撤销。这一规定体现了对被害人意愿的尊重，同时也避免了不必要的刑事追诉。
犯罪嫌疑人、被告人死亡的：
- 犯罪行为基于犯罪主体的有意识活动，若犯罪嫌疑人或被告人死亡，其刑事责任能力自然消灭，无法再追究其刑事责任，因此应撤案。这里的“死亡”包括自然死亡和宣告死亡两种情况。在审理过程中被告人死亡，且能确认其无罪的，应判决宣告无罪。但需注意，涉及财产犯罪需追缴违法所得或其他涉案财产，或存在共同犯罪嫌疑人的，仍应继续侦查或审理。
其他法律规定免予追究刑事责任的：
- 这是一个兜底条款，涵盖除上述五种情形外，其他法律规定的免予追究刑事责任的特殊情形。随着法律体系的不断完善，可能有新的法律规定出现，符合该情形的刑事案件也可撤销。这一规定确保了刑事法律的灵活性和适应性，能够应对各种复杂的法律情况。
撤案后的处理流程：
- 撤销案件后，侦查机关应立即释放犯罪嫌疑人（如果已被逮捕），并发给释放证明，确保其人身自由权利不受侵犯。
- 同时，侦查机关应当及时将撤销案件及释放犯罪嫌疑人的情况通知原批准逮捕的人民检察院，以便人民检察院及时了解案件进展情况，依法履行法律监督职责。
- 对原犯罪嫌疑人采取的其他强制措施，如取保候审、监视居住等，应当立即解除。
- 对查封、扣押的财物及其孳息、文件，或者冻结的财产，除按照法律和有关规定另行处理的以外，应当解除查封、扣押、冻结，确保犯罪嫌疑人的合法财产权益不受损害。
撤案的法律效果：
撤销案件意味着侦查机关终止了对犯罪嫌疑人的刑事追诉程序，犯罪嫌疑人在该案件中的刑事责任得以解除。然而，这并不意味着犯罪嫌疑人完全摆脱了法律责任。如果其行为涉及行政违法或其他法律责任，仍需依法接受相应的处理或移交有关部门。
在实际操作中，侦查机关应严格遵循相关法律法规，确保撤销案件的决策过程合法、合理、公正，切实保障犯罪嫌疑人的合法权益。如果您在刑事诉讼方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。