关于不真实协议超过三年是否还能起诉的问题，结论前置：这主要取决于协议的性质、诉讼时效的起算点以及是否存在诉讼时效中断或中止的情形。 以下我将从多个角度进行详细分析：
一、协议性质与诉讼时效
民事协议的一般诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果协议纠纷属于一般的民事权利纠纷，且没有特殊规定，那么诉讼时效期间一般为三年。
特殊协议的诉讼时效：
- 某些特殊类型的协议，如因国际货物买卖合同和技术进出口合同争议提起诉讼或申请仲裁的期限，可能适用不同的诉讼时效规定。但这些情况较为特殊，不常见于一般的不真实协议纠纷中。
二、诉讼时效的起算点
知道或应当知道权利受损之日：
- 诉讼时效期间通常从权利人知道或应当知道其权利受到损害以及义务人之日起计算。对于不真实协议，如果当事人在签订时即发现协议不真实，那么诉讼时效可能从签订之日起算；如果当事人在签订后一段时间才发现协议不真实，那么诉讼时效则可能从发现之日起算。
最长诉讼时效：
- 除了从知道或应当知道权利受损之日起算的诉讼时效外，还存在一个最长诉讼时效期间，即自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。但这一规定主要适用于权利人不知道或不应知道其权利受到损害的情况。
三、诉讼时效的中断与中止
诉讼时效中断：
- 在诉讼时效期间内，如果因法定事由（如权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等）导致诉讼时效中断，那么从中断时起，诉讼时效期间将重新计算。这意味着，即使协议纠纷已经超过三年，但如果存在诉讼时效中断的情形，当事人仍然有可能在中断后的新诉讼时效期间内提起诉讼。
诉讼时效中止：
- 在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因法定事由（如不可抗力或其他障碍）导致权利人不能行使请求权，那么诉讼时效将中止。从中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间将届满。这意味着，在特定情况下，即使协议纠纷已经接近或超过三年，但因诉讼时效中止而可能延长诉讼时效期间。
四、不真实协议的特殊性
- 对于不真实协议，除了考虑上述一般的诉讼时效规定外，还需要考虑协议的具体内容、签订过程以及当事人的主观意图等因素。如果协议存在欺诈、胁迫等情形，当事人可能享有撤销权或变更权，这些权利的行使也可能影响诉讼时效的计算。
五、建议与结论
- 建议：如果您发现协议不真实且希望维护自己的合法权益，建议您尽快咨询专业律师以评估您的具体情况和可能的法律途径。律师将根据您的具体情况，结合相关法律法规和司法实践，为您提供专业的法律意见和诉讼策略。
- 结论：不真实协议超过三年是否还能起诉，并没有一个简单的答案。它取决于多种因素，包括协议的性质、诉讼时效的起算点以及是否存在诉讼时效中断或中止的情形。因此，如果您面临此类问题，请务必及时咨询专业律师以获取准确的法律意见。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。