法院不予撤销在人民调解委员会签订的显失公平的工伤赔偿协议，可能存在以下几种原因：

1. 未在法定时效内行使撤销权：

   • 法律依据：根据《民法典》的相关规定，当事人自知道或者应当知道撤销事由之日起一年内（重大误解的当事人自知道或者应当知道撤销事由之日起九十日内）没有行使撤销权的，撤销权消灭。若当事人受胁迫，则自胁迫行为终止之日起一年内没有行使撤销权的，撤销权同样消灭。
   • 分析：如果受伤职工在签订显失公平的工伤赔偿协议后，未在上述法定时效内及时向法院提起诉讼，请求撤销该协议，那么法院将因撤销权已消灭而无法支持其请求。

2. 证据不足，无法证明协议显失公平：

   • 法律依据：在申请撤销工伤赔偿协议时，受伤职工需要提供充分的证据证明协议存在显失公平的情形。
   • 分析：如果受伤职工无法提供足够的证据，如赔偿标准对比文件、市场行情资料等，来证明协议约定的赔偿数额明显低于法定的工伤赔偿标准，或者无法证明用人单位利用了其处于危困状态、缺乏判断能力等情形，那么法院将难以认定协议显失公平，从而不予撤销。

3. 协议内容虽显失公平，但已实际履行且未造成严重后果：

   • 分析：在某些情况下，即使工伤赔偿协议内容显失公平，但如果该协议已经实际履行，且未对受伤职工造成严重后果（如未导致其生活陷入困境、未影响其后续治疗等），法院可能会从维护交易稳定和社会和谐的角度出发，不予撤销该协议。不过，这种情况并非绝对，具体还需根据案件实际情况和法院的裁量权来判断。

4. 法院对“显失公平”的认定存在分歧：

   • 分析：显失公平的认定存在一定的主观性和灵活性，不同法院或法官可能对同一案件是否存在显失公平的情形存在不同看法。如果法院认为协议虽然在一定程度上对受伤职工不利，但并未达到显失公平的程度，那么法院将不予撤销该协议。

针对上述情况，我给出以下建议：

• 及时行使撤销权：受伤职工在发现工伤赔偿协议存在显失公平的情形后，应尽快向法院提起诉讼，请求撤销该协议，以免因超过法定时效而丧失撤销权。
• 充分收集证据：在申请撤销工伤赔偿协议时，受伤职工应尽可能收集充分的证据来证明协议存在显失公平的情形，如赔偿标准对比文件、市场行情资料、沟通记录等。
• 咨询专业律师：由于工伤赔偿协议的撤销涉及复杂的法律问题和证据收集工作，受伤职工在处理此类案件时最好咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保障。不过，既然您已经向我咨询，我会尽我所能为您提供专业的法律帮助。

若您在工伤赔偿协议方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。