签了自动离职协议后，仍然可以申请劳动仲裁，但具体能否成功以及仲裁的诉求会受到多种因素的影响。以下是对此问题的详细分析：
一、可申请劳动仲裁的情形
存在重大误解或显失公平
- 如果在签订自动离职协议时，您对协议内容存在重大误解，或者协议内容显失公平（例如，用人单位利用优势地位迫使您接受不合理的条款），您有权请求撤销该协议，并基于原劳动关系中的争议事项申请劳动仲裁。
用人单位未履行协议约定
- 自动离职协议中可能包含关于工资支付、经济补偿金、社保缴纳等方面的约定。如果用人单位未按照协议约定履行义务，您可以就这些未履行的部分申请劳动仲裁。
发现新的证据或事实
- 在签订自动离职协议后，如果您发现了与劳动争议相关的新证据或事实，且这些证据或事实能够支持您的仲裁请求，那么您也可以据此申请劳动仲裁。
协议内容违法或无效
- 如果自动离职协议的内容违反了法律法规的强制性规定，或者存在其他导致协议无效的情形（如欺诈、胁迫等），那么该协议自始无效，您当然可以基于原劳动关系中的争议事项申请劳动仲裁。
二、申请劳动仲裁的注意事项
时效问题
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。因此，您在发现权益受到侵害后，应及时申请仲裁，以免错过时效。
证据收集
- 在申请仲裁前，您应尽可能收集与争议事项相关的证据，如劳动合同、工资条、工作记录、自动离职协议等。这些证据将有助于支持您的仲裁请求。
明确仲裁请求
- 在申请仲裁时，您应明确自己的仲裁请求，包括要求用人单位支付的金额、履行的义务等。同时，应提供充分的证据和理由来支持自己的请求。
遵循法律程序
- 您在申请仲裁时，应遵循法律程序，按照仲裁委员会的要求提交相关材料，并按时参加仲裁庭审。劳动仲裁流程包括提交仲裁申请书、仲裁委员会决定是否受理、被申请人提交答辩书、开庭通知、开庭与质证、调解与裁决以及结案等步骤，您需要确保每一步都符合法律要求。
三、劳动仲裁流程简介
提交仲裁申请书
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十八条，您需要提交书面仲裁申请，并按照被申请人人数提交副本。仲裁申请书应载明您的基本信息、用人单位的基本信息、仲裁请求及其依据的事实和理由，以及相关证据和证据来源。
受理与否决定
- 劳动争议仲裁委员会在收到仲裁申请书后，应在五日内决定是否受理，并书面通知您。如果决定受理，会同时将仲裁申请书副本送达被申请人。
被申请人答辩
- 被申请人收到仲裁申请书副本后，应在十日内向劳动争议仲裁委员会提交答辩书。仲裁委会在收到答辩书后五日内将其副本送达您。如被申请人未提交答辩书，不影响仲裁程序的进行。
开庭与质证
- 在仲裁过程中，您有权进行质证和辩论。质证和辩论终结时，仲裁员会征询您的最后意见。
调解与裁决
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十二条，仲裁庭在作出裁决前，应先行调解。如果调解达成协议，仲裁庭会制作调解书，由双方当事人签收后发生法律效力。如果调解不成或者调解书送达前一方当事人反悔，仲裁庭会及时作出裁决。
结案
- 仲裁庭处理劳动争议案件，一般应自组成仲裁庭之日起四十五日内结案，如有需要延长的特殊情况，延长期限不得超过十五日。
总结来说，即使签了自动离职协议，您仍然有可能通过劳动仲裁来维护自己的权益。但具体能否成功以及仲裁的诉求会受到多种因素的影响，因此建议您在申请仲裁前咨询专业律师（即我本人，邓青青律师，专注于刑事辩护、合同纠纷、劳动纠纷领域），以确保您的权益得到妥善处理。如果您有任何法律问题，可以直接向我咨询。