疾控中心查出梅毒一般不会通知单位，也不会直接导致单位开除员工。以下是对此问题的详细分析：

一. 疾控中心对梅毒病例的处理

根据《中华人民共和国传染病防治法》及其实施细则，梅毒被列为乙类传染病进行防治管理。当疾控中心查出梅毒病例时，主要会进行以下处理：

1. 传染病报告登记：疾控中心会按照法定程序对梅毒病例进行报告登记，以便对传染病进行监测和管理。
2. 隐私保护：在报告和登记过程中，疾控中心会严格遵守隐私保护原则，不会随意泄露患者的个人信息，包括工作单位等。

二. 单位开除员工的法律依据

关于单位开除员工的法律依据，主要依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。根据该法第三十九条，用人单位可以解除劳动合同的情形主要包括：

1. 劳动者在试用期间被证明不符合录用条件的；
2. 严重违反用人单位的规章制度的；
3. 严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
4. 劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
5. 因劳动者以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使用人单位在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同，致使劳动合同无效的；
6. 被依法追究刑事责任的。

其中并未提及劳动者患梅毒会导致用人单位解除劳动合同。因此，单纯因劳动者患梅毒而开除员工，并不符合《中华人民共和国劳动合同法》的规定。

三. 特殊情况下的考量

虽然疾控中心查出梅毒不会通知单位，且单位无权因员工患梅毒而直接开除，但在某些特殊情况下，单位可能会对员工的工作安排进行调整：

1. 职业健康安全考虑：如果员工在医疗机构工作或涉及公共健康安全的职业，其梅毒病情可能对工作环境和他人健康构成潜在威胁。在这种情况下，单位可能会与员工协商调整工作岗位或采取其他防护措施。
2. 员工病情对工作的影响：如果员工的梅毒病情严重影响其工作能力和工作完成，或者经治疗仍无法胜任工作，单位可能会依据相关法律法规和劳动合同的约定进行辞退。但这种情况下，单位需证明辞退行为的合法性和合理性。

我的观点：疾控中心查出梅毒后，一般不会通知单位，且单位无权因员工患梅毒而直接开除。然而，在某些特殊情况下，单位可能会出于职业健康安全或员工工作能力等方面的考虑，与员工协商调整工作岗位或采取其他措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。