祖辈土地交换协议书在父亲去世后是否有效，这主要取决于协议书本身的合法性、有效性以及是否涉及到您父亲的权利义务。以下从多个角度进行分析：

1. 协议书本身的合法性与有效性：

   • 如果祖辈土地交换协议书是在双方自愿、平等、公平的基础上签订的，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议书在签订时就是合法有效的。
   • 合法有效的协议书，其效力并不因一方当事人的去世而自动失效。除非协议书中明确约定了协议效力与特定当事人的生存状态相关联，或者法律、行政法规有特别规定。

2. 协议书是否涉及您父亲的权利义务：

   • 如果协议书中的权利义务完全由祖辈双方承担，且您父亲并非协议书的当事人，那么您父亲的去世对协议书的效力没有影响。
   • 如果协议书中涉及您父亲的权利义务，比如您父亲作为协议的一方继承人或者受让人，继承了协议中的权利或承担了义务，那么您父亲的去世可能会引发协议权利义务的继承问题。但即便如此，也不意味着协议书本身失效，而是协议中的权利义务可能由您父亲的继承人继续承担。

3. 特殊情况下的协议书效力：

   • 如果协议书存在欺诈、胁迫、显失公平等情形，导致协议书在签订时即存在效力瑕疵，那么无论您父亲是否去世，该协议书都可能被依法撤销或认定无效。
   • 如果协议书涉及的土地使用权存在争议或纠纷，且该争议或纠纷在您父亲去世后仍未解决，那么协议书的效力可能会受到争议或纠纷的影响。但这种情况下的影响并非直接由您父亲的去世导致，而是由土地使用权本身的争议或纠纷导致。

法律建议：

• 如果您对祖辈土地交换协议书的效力存在疑问，或者该协议书涉及到您父亲的权利义务，建议您先仔细审查协议书的内容，了解协议书的签订背景、目的和条款。
• 如果协议书内容复杂或存在争议，您可以考虑咨询专业的法律人士，比如向我咨询，以便更准确地评估协议书的效力以及可能涉及的法律风险。
• 在处理涉及土地交换协议书的事务时，务必保持谨慎和理性，避免因处理不当而引发不必要的法律纠纷。