发现已迁走的墓地遗迹时，应立即停止施工并保护现场，同时按以下步骤处理：

1. 确认墓地迁移的合法性
   首先需核实该墓地迁移是否已依法完成所有手续。根据《殡葬管理条例》第十条，迁移坟墓需经县级政府批准并公告，迁移后应注销原墓地登记。若迁移手续完备且已注销，施工方可继续作业，但需对现场进行文物价值评估（若涉及历史遗迹）。

2. 若迁移手续存在瑕疵

   • 联系原迁移方补办手续：若发现迁移未获批准或未公告，需立即联系原迁移主体（如家属或民政部门）补办手续，避免施工行为被认定为“破坏坟墓”（可能触犯《治安管理处罚法》第六十五条）。
     
   • 暂停施工并划定保护范围：在手续补办期间，施工方应划定50米以上保护范围，禁止机械作业，仅允许人工清理，防止对潜在遗物造成二次破坏。

3. 涉及文物或历史遗迹的特殊处理
   若墓地遗迹具有历史价值（如清代以上古墓），需按《文物保护法》第三十二条处理：

   • 立即报告当地文物行政部门，由其组织考古发掘；
     
   • 施工方需配合调整施工方案，可能涉及设计变更或工期延长；
     
   • 若因保护文物导致损失，可依据《文物保护法》第六条向政府申请补偿。

4. 民事赔偿风险的防范
   即使墓地已迁移，若施工导致原墓地附属物（如墓碑、祭祀设施）损坏，仍可能面临原家属的侵权索赔。建议：

   • 施工前通过村委会或派出所确认墓地迁移情况；
     
   • 对现场进行全程录像取证；
     
   • 购买工程一切险，将此类风险纳入保险范围。

实务建议：发现此类情况后，建议施工方在24小时内形成书面报告，附现场照片、迁移文件复印件等证据，同步报送住建部门、民政部门及文物部门。若涉及少数民族墓地，还需通知民族宗教事务部门参与处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。