若发现劳动监察整改指令书存在错误，可通过申请行政复议或提起行政诉讼的方式维护自身合法权益，具体分析如下：

1. 申请行政复议
   根据《行政复议法》第九条，公民、法人或其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可自知道该行为之日起60日内提出行政复议申请。若认为劳动监察整改指令书存在事实认定错误（如错误认定未支付工资、未缴纳社保等）、程序违法（如未依法送达、未听取陈述申辩）或适用法律错误（如错误引用法律条款），可向作出指令的劳动监察部门的上一级主管部门或同级人民政府申请复议。复议机关将审查指令书的合法性与合理性，若确认错误，将依法撤销、变更或确认违法。

2. 提起行政诉讼
   若对行政复议结果不服，或未选择复议程序，可直接向法院提起行政诉讼（《行政诉讼法》第四十四条）。法院将全面审查指令书的合法性，包括主体资格、程序、事实认定及法律适用。若法院认定指令书违法，将判决撤销、部分撤销或要求重新作出行政行为。需注意，行政诉讼需在知道指令书内容之日起6个月内提出，逾期可能丧失诉权。

操作建议：

• 收集证据：整理与指令书错误相关的证据（如工资发放记录、社保缴纳凭证、沟通记录等），证明指令书内容与事实不符。
  
• 法律文书撰写：行政复议申请书或行政起诉状需明确请求（如撤销指令书）、事实与理由（指出错误点及法律依据），建议委托律师起草以确保规范性。
  
• 时效把控：严格注意复议与诉讼的期限，避免因超期丧失救济权利。
  

若指令书错误已导致实际损失（如被错误处罚、企业声誉受损），可同步主张行政赔偿，但需证明损失与指令书错误存在直接因果关系。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。