借款超过三年仍然可以起诉，但需注意诉讼时效抗辩的风险及特殊规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、诉讼时效的一般规定
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这一期限自权利人知道或应当知道权利受损及义务人之日起计算。这并不意味着三年后债权人就丧失了起诉权，而是若被告以诉讼时效届满为由抗辩，且法院查明无中止、中断或延长情形，原告可能丧失胜诉权。
二、超过三年起诉的可能情况
对方未提出诉讼时效抗辩：
- 若在诉讼过程中，被告（即借款方）并未以诉讼时效已过为由进行抗辩，法院将不会主动适用诉讼时效的规定。此时，你的起诉依然有效，法院会正常审理该借款合同纠纷案件，并依据双方提供的证据来认定事实，作出相应的判决。
对方提出诉讼时效抗辩：
- 如果被告以诉讼时效已过进行抗辩，并且法院经审查认为确实已过诉讼时效且不存在诉讼时效中止、中断等情形，那么法院可能会判决驳回你的诉讼请求。但这并不意味着你的实体权利消灭，只是你丧失了通过法院强制对方还款的胜诉权。
三、诉讼时效的中止与中断
诉讼时效中断：
- 在三年的诉讼时效期间内，如果你曾向对方主张过权利，如通过书面催款函、短信、微信等方式要求对方还款，或者对方曾承诺过还款，这些行为都将导致诉讼时效中断。从中断时起，诉讼时效期间将重新计算。例如，若你在借款到期后两年时向对方发送了催款短信，那么诉讼时效将从发送短信之日起重新计算三年。
诉讼时效中止：
- 在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力等法定障碍导致你无法行使请求权，诉讼时效将中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。例如，若你在诉讼时效期间的最后六个月内因突发疾病无法行使请求权，且该疾病持续了三个月，那么诉讼时效将中止三个月，自疾病痊愈之日起再计算六个月后诉讼时效期间届满。
四、实际操作建议
及时收集并保存相关证据：
- 无论借款是否超过三年，你都应妥善保留相关证据，如借条、转账记录、聊天记录等，以证明借贷关系的存在以及在诉讼时效内有主张过权利的事实。这些证据对于法院依法作出判决至关重要。
关注诉讼时效的中止、中断情形：
- 确保在有效期内提起诉讼，或通过合法手段导致诉讼时效中断或中止，以延长你的胜诉权保护期限。
合理评估起诉的时机与必要性：
- 虽然法律未设定起诉的时间限制，但若双方已约定还款时间，且该时间已过许久，法院在审理时可能会考虑此因素，评估起诉的合理性与必要性。因此，及时行使权利，避免长时间拖延，有助于增强起诉的正当性。
五、特殊规定与注意事项
最长诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。这意味着，即使存在诉讼时效中断或中止的情形，你的权利保护期限也不会超过二十年。
地区法律规定的差异：
- 由于不同地区的司法实践可能存在差异，建议在起诉前了解当地的具体法律规定和程序要求。这有助于确保诉讼策略的针对性和有效性，避免因不了解地方规定而带来的不必要的法律风险。
综上所述，借款超过三年仍然可以起诉，但需注意诉讼时效抗辩的风险及特殊规定。为确保自身权益得到有效维护，建议你根据上述建议制定合适的诉讼策略，并在必要时直接向我咨询相关法律问题。