工厂实行12小时两班倒制度未被查处，并不意味着该制度完全合法或不受监管，其背后可能涉及多种因素。以下从不同角度为你详细分析：

一、法律层面：超时加班的违法性

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。若因生产经营需要，用人单位经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间，但一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。

12小时两班倒制度明显超出了上述法定工作时间限制，属于超时加班，是违法的。然而，为何有些工厂仍然实行这种制度而未被查处呢？这可能涉及以下几个方面的原因：

1. 执法力度与监管资源：劳动监察部门的执法力度和监管资源有限，可能无法对所有用人单位进行全面、及时的监管。一些工厂可能因此心存侥幸，继续实行超时加班制度。
2. 劳动者维权意识：部分劳动者可能由于担心失业、收入减少或不了解自身权益等原因，选择默默忍受超时加班，没有向劳动监察部门投诉或举报。
3. 地方政策与执法尺度：不同地区可能存在不同的政策导向和执法尺度。一些地方可能为了促进经济发展或吸引投资，对超时加班等违法行为采取相对宽松的态度。

二、工厂角度：追求经济效益与成本控制

从工厂的角度来看，实行12小时两班倒制度可能是出于追求经济效益和成本控制的考虑。通过延长工作时间，工厂可以在不增加员工数量的情况下提高生产量，从而降低单位产品的生产成本。然而，这种做法往往以牺牲劳动者的休息权和健康权为代价，长期来看并不利于企业的可持续发展。

三、劳动者角度：权益保护与维权途径

对于劳动者而言，面对超时加班等违法行为，应积极维护自身权益。以下是一些建议：

1. 了解自身权益：劳动者应了解《劳动法》等相关法律法规中关于工作时间、加班工资等方面的规定，明确自己的权益。
2. 与用人单位协商：在发现用人单位存在超时加班等违法行为时，劳动者可以尝试与用人单位进行协商，要求其改正违法行为并支付相应的加班工资。
3. 向劳动监察部门投诉或举报：如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或举报用人单位的违法行为。劳动监察部门将依法进行调查处理，并保护劳动者的合法权益。
4. 寻求法律援助：在维权过程中，劳动者如果遇到困难或需要法律帮助，可以寻求法律援助机构的支持或咨询专业律师的意见。

工厂实行12小时两班倒制度是违法的，但可能由于执法力度、劳动者维权意识、地方政策等多种因素而未被查处。作为劳动者，应积极了解自身权益并采取相应的维权措施；作为用人单位，应遵守法律法规，保障劳动者的合法权益。如果你有任何关于劳动工伤方面的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。