公司要求签订特殊工时制，通常是为了更灵活地安排员工的工作时间，以适应特定行业或岗位的工作需求，但这也可能涉及到员工加班、休息休假等权益的调整。以下是对这一问题的详细分析：

一、特殊工时制的定义与类型

特殊工时制是相对于标准工时制而言的，它主要包括不定时工作制和综合计算工时工作制两种类型。

1. 不定时工作制：适用于因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工。例如，高级管理人员、外勤人员、推销人员等。
2. 综合计算工时工作制：适用于因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工。例如，交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等行业中因工作性质特殊，需连续作业的职工，以及地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节和自然条件限制的行业的部分职工。

二、公司要求签订特殊工时制的原因

1. 适应行业特点：某些行业由于工作性质特殊，如连续作业、季节性工作等，无法按照标准工时制进行安排，因此需要采用特殊工时制。
2. 提高工作效率：特殊工时制可以更灵活地安排员工的工作时间，有助于提高工作效率和生产力。
3. 降低成本：通过合理安排工作时间，公司可以减少加班费用的支出，从而降低运营成本。

三、特殊工时制对员工权益的影响

1. 加班与休息休假：在特殊工时制下，员工的加班和休息休假安排可能与标准工时制有所不同。例如，不定时工作制的员工可能无法享受固定的双休日和法定节假日休息，但他们的加班工资计算方式也可能有所不同。综合计算工时工作制的员工则可能在某个周期内的工作时间超过标准工时，但在其他周期内则可能少于标准工时。
2. 工资计算：特殊工时制下的工资计算方式也可能与标准工时制不同。公司需要确保员工的工资计算方式符合相关法律法规的规定，避免侵犯员工的合法权益。

四、员工应对策略

1. 了解相关法律法规：在签订特殊工时制合同前，员工应了解相关法律法规的规定，确保自己的权益不受侵犯。例如，了解加班工资的计算方式、休息休假的安排等。
2. 与公司沟通协商：如果员工对特殊工时制有疑问或担忧，可以与公司进行沟通协商，明确双方的权利和义务。例如，可以就加班、休息休假等问题与公司达成书面协议。
3. 保留相关证据：在特殊工时制下，员工应保留好与工作时间、工资计算等相关的证据，以便在发生劳动争议时维护自己的合法权益。

五、法律建议

1. 公司应依法申请特殊工时制：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，公司实行特殊工时制需要经过劳动行政部门的批准。因此，公司在要求员工签订特殊工时制合同时，应确保已经依法获得了相关部门的批准。
2. 公司应明确告知员工特殊工时制的具体内容：在签订特殊工时制合同前，公司应向员工明确告知特殊工时制的具体内容、加班和休息休假的安排、工资计算方式等，确保员工在充分了解的基础上做出选择。

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