民事被告两次不出庭导致转为普通程序，增加的诉讼费原则上由原告先行垫付，最终承担方需根据案件具体情况和法院判决确定，一般有以下两种处理方式：

1. 若原告胜诉，增加的诉讼费通常由被告承担
   根据《诉讼费用交纳办法》第二十九条，诉讼费用由败诉方负担。若被告因不出庭导致案件转为普通程序（例如简易程序转普通程序需补交诉讼费），且法院最终判决原告胜诉，则增加的诉讼费（如普通程序与简易程序差额部分）应由被告承担。原告可在执行阶段申请法院从被告财产中扣划该费用。

2. 若原告部分胜诉或败诉，诉讼费按比例分担
   若法院判决双方分担责任（如原告部分诉求被驳回），则增加的诉讼费可能按胜诉、败诉比例由原被告分担。例如，原告主张10万元，法院支持8万元，则被告可能承担80%的增加费用，原告承担20%。

关键提醒：

• 诉讼费承担以法院最终判决为准，被告不出庭不影响法院对费用分担的裁判；
  
• 若原告因被告不出庭产生其他合理费用（如差旅费、律师费），除非合同或法律明确规定，否则一般需自行承担；
  
• 建议原告在起诉时明确主张“诉讼费由被告承担”，并在庭审中提交费用缴纳凭证作为证据。

操作建议：

1. 保留诉讼费缴纳票据，作为后续主张的依据；
   
2. 若被告未履行费用支付义务，可在判决生效后申请强制执行；
   
3. 若对费用分担有异议，可在上诉期内提起上诉。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件情况。