公司领导搜身翻包的行为是不合法的，这一结论主要基于以下法律角度的分析：
侵犯公民人身自由权：
- 根据《中华人民共和国宪法》第三十七条的规定，中华人民共和国公民的人身自由不受侵犯。任何公民，非经人民检察院批准或者决定或者人民法院决定，并由公安机关执行，不受逮捕。禁止非法拘禁和以其他方法非法剥夺或者限制公民的人身自由，禁止非法搜查公民的身体。公司领导无权对员工进行搜身或翻包，这种行为直接侵犯了员工的人身自由权。
侵犯公民隐私权：
- 隐私权是公民的重要权利之一，受到法律的保护。搜身翻包行为往往涉及对员工个人隐私的侵犯，如查看员工的私人物品、文件等，这违反了隐私权保护的原则。
可能构成违法行为：
- 如果公司领导强行对员工进行搜身或翻包，且情节严重，可能构成《中华人民共和国刑法》中的非法搜查罪。虽然这种情况较为极端，但一旦发生，公司领导将面临刑事责任的追究。
公司规章制度与法律相抵触无效：
- 即使公司内部有相关规定允许领导对员工进行搜身或翻包，但这种规定如果与法律相抵触，也是无效的。员工有权拒绝执行此类违法规定，并可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
法律建议：
- 员工角度：如果遭遇公司领导搜身或翻包，员工应坚决拒绝，并明确告知领导这种行为是违法的。如果领导坚持进行，员工可以记录下相关证据（如视频、音频、证人证言等），并向公安机关报案或向劳动监察部门投诉。
- 公司角度：公司应尊重员工的合法权益，避免采取任何侵犯员工人身自由或隐私权的行为。公司可以制定合理的安保措施，如设置安检设备、加强门禁管理等，以确保公司财产和员工安全，但这些措施必须合法合规，不得侵犯员工的合法权益。
可能后果：
- 如果公司领导因搜身或翻包行为被认定为违法，可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任等后果。同时，这种行为也会严重损害公司的形象和声誉，影响公司的长期发展。
综上所述，公司领导搜身翻包的行为是不合法的，员工应坚决维护自己的合法权益，公司也应遵守法律法规，尊重员工的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。