结论：国道两侧的土地，即使企业已取得土地证，是否可以建设厂房还需根据土地的具体性质、规划用途以及相关法律法规的规定来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 土地性质与规划用途：

   • 土地性质：首先，需要明确该土地是国有土地还是集体土地，以及具体的土地用途（如工业用地、商业用地、住宅用地等）。不同性质的土地，其使用规定和限制也不同。
   • 规划用途：其次，要查看该土地在城乡规划中的用途。如果规划为工业用地，且符合其他建设条件，那么建设厂房可能是允许的。但如果规划为其他用途，如绿地、道路、公共设施等，则可能不允许建设厂房。

2. 相关法律法规：

   • 土地管理法：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，使用土地必须符合土地利用总体规划和城乡规划，并依法取得土地使用权。未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，将受到法律制裁。
   • 城乡规划法：同时，根据《中华人民共和国城乡规划法》的规定，在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物、道路、管线和其他工程建设的，建设单位或者个人应当向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。
   • 公路法：此外，如果土地位于国道两侧，还需考虑《中华人民共和国公路法》的相关规定。该法规定，在公路两侧一定范围内（具体范围由省、自治区、直辖市人民政府规定）不得挖砂、采石、取土、倾倒废弃物，不得进行爆破作业及其他危及公路安全的活动。对于建设厂房等建筑物，也需符合该法及其实施细则的相关规定，确保不影响公路的安全和畅通。

3. 实际操作建议：

   • 查询规划：企业应首先查询该土地在城乡规划中的具体用途，以及是否允许建设厂房。
   • 办理手续：如果符合规划用途，企业还需依法办理土地使用权出让、转让手续，以及建设工程规划许可证等相关手续。
   • 咨询相关部门：在办理过程中，企业应积极咨询当地国土资源部门、城乡规划部门以及公路管理部门等相关部门的意见，确保建设活动符合法律法规的规定。

可能后果：如果企业未经批准或不符合规划用途在国道两侧建设厂房，可能面临被责令停止建设、限期拆除、罚款等法律后果。同时，如果建设活动影响了公路的安全和畅通，还可能承担相应的民事责任或刑事责任。

因此，企业在国道两侧建设厂房前，务必进行充分的法律研究和咨询，确保建设活动符合法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。