年休假工资是按照应发工资来计算，而非实发工资。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与计算方式

根据《企业职工带薪年休假实施办法》第十一条的规定，计算未休年休假工资报酬的日工资收入，是按照职工本人的月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算的。这里的“月工资”指的是职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资。若职工在本用人单位工作时间不满12个月，则按实际月份计算月平均工资。这一规定明确了年休假工资的计算基数是应发工资，即未扣除社保、公积金、个税等费用前的工资。

二、应发工资与实发工资的区别

• 应发工资：是员工在正常出勤情况下应获得的全部劳动报酬，包括基本工资、岗位津贴、绩效奖金等固定和常规的收入部分。它反映了员工在未扣除任何费用前的完整收入水平。
• 实发工资：是应发工资扣除社保个人缴纳部分、公积金个人缴纳部分、个人所得税及其他代扣款项后的金额。由于包含了多项扣除项，实发工资通常低于应发工资。

三、为何选择应发工资作为计算基数

1. 保障劳动者权益：以应发工资为基数计算年假工资，能够确保劳动者在休假期间获得与正常工作期间相当的经济待遇，避免因扣款导致收入减少，从而保障劳动者的合法权益。
2. 体现公平性：应发工资包含了劳动者的全部劳动所得，以此为基数计算年假工资更符合公平原则。如果以实发工资为基数，可能会因扣款差异导致待遇不公。
3. 符合立法本意：相关法律法规明确规定，年假工资的计算基数应为劳动者正常工作期间的工资收入。应发工资正是这一概念的直接体现，因此选择应发工资作为计算基数是符合立法本意的。

四、实际应用与注意事项

在实际应用中，用人单位在计算年休假工资时，应严格按照法律法规的规定进行，确保计算基数的准确性。同时，劳动者也有权要求用人单位按照应发工资的标准支付年休假工资，并在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。

总结来说，年休假工资是按照应发工资来计算的。这一规定旨在保障劳动者的合法权益，体现公平性，并符合立法本意。如果您在年休假工资方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。