事业单位员工不服从工作安排，单位不可以直接停职，但可以根据具体情况和规定进行处理。以下从不同角度进行分析：
一、事业单位与员工的关系及合同规定
事业单位与员工之间建立的是人事关系，但这一关系同样需要通过合同形式来明确和规范。根据《中华人民共和国劳动合同法》第二条以及《事业单位人事管理条例》的相关规定，事业单位与工作人员应当订立聘用合同，合同中应明确岗位及其职责要求。这意味着，员工有义务按照合同约定履行工作职责，而单位也有权根据合同对员工进行管理。
二、不服从工作安排的处理方式
合同约定与规章制度：
- 如果聘用合同或单位的规章制度中明确规定了不服从工作安排的后果，如警告、记过、降职、解聘等，那么单位可以依据这些规定对员工进行处理。
- 但需要注意的是，这些处理措施必须合法、合理，且不能违反法律法规的强制性规定。
停职的合法性：
- 停职通常不是一种法定的处理措施，而是单位内部的一种管理手段。在事业单位中，停职可能涉及员工的薪酬、福利等权益，因此必须谨慎使用。
- 如果单位想要对不服从工作安排的员工进行停职处理，必须确保这一措施有明确的合同依据或规章制度支持，且符合法律法规的规定。否则，员工有权向劳动争议仲裁机构或人民法院提起申诉或诉讼，维护自己的合法权益。
合法处理措施：
- 对于不服从工作安排的员工，单位可以首先尝试与员工进行沟通协商，了解其不服从的原因，并寻求解决方案。
- 如果沟通无果，单位可以根据合同约定或规章制度，对员工进行警告、记过等纪律处分。
- 在严重情况下，如员工的行为严重违反了合同约定或规章制度，且对单位造成了重大损失或影响，单位可以考虑解除与员工的聘用合同。
三、法律后果与风险提示
- 对单位：如果单位在没有合法依据的情况下对员工进行停职处理，可能面临法律风险，如被员工提起申诉或诉讼，要求恢复工作、赔偿损失等。
- 对员工：如果员工不服从工作安排且没有合理理由，可能会受到单位的纪律处分，甚至被解除聘用合同。这将对员工的职业生涯和声誉造成不良影响。
四、建议与措施
- 单位：应建立健全的规章制度和合同管理机制，明确员工的工作职责和不服从工作安排的后果。在处理不服从工作安排的员工时，应确保处理措施合法、合理，并遵循正当程序。
- 员工：应认真履行工作职责，遵守单位的规章制度和合同约定。如果对工作安排有异议或困难，应及时与单位沟通协商，寻求解决方案。
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