针对您提出的问题，即工程已竣工验收合格，但使用单位迟迟不办理接收手续却已实际使用，责任主体及主要责任的分析如下：

1. 责任主体界定：

   • 在此情境下，责任主体主要涉及两个方面：一是工程的发包方（或建设单位），二是实际使用单位。发包方作为工程的委托方，有责任确保工程按照合同要求完成并接收；而实际使用单位，尽管未办理正式接收手续，但已实际使用工程，也需承担相应责任。

2. 主要责任分析：

   • 发包方责任：
     • 发包方有义务按照合同约定的时间和条件接收工程。若发包方无正当理由拒绝接收或拖延接收，可能构成违约，需承担违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。
     • 发包方还应确保工程竣工验收合格，并办理相关接收手续。若因发包方原因导致手续未办，发包方需承担相应责任。
   • 实际使用单位责任：
     • 尽管未办理正式接收手续，但实际使用单位已实际使用工程，应视为对工程质量的认可。因此，实际使用单位需承担工程使用过程中的相关责任，如维护、保养等。
     • 若实际使用单位因未办理接收手续而拒绝支付工程款或要求发包方承担额外责任，可能缺乏法律依据，需根据实际情况和合同约定进行判断。

3. 法律建议：

   • 对于发包方：
     • 应尽快与实际使用单位沟通，明确接收手续的具体要求和流程，确保工程顺利接收。
     • 若实际使用单位无正当理由拒绝接收或拖延接收，发包方可依据合同约定和相关法律法规，要求实际使用单位承担违约责任。
   • 对于实际使用单位：
     • 应积极配合发包方办理接收手续，确保工程合法、合规使用。
     • 若因特殊原因无法及时办理接收手续，应与发包方协商解决方案，避免产生不必要的法律纠纷。

4. 可能的法律后果：

   • 若双方未能就接收手续达成一致，可能导致工程长期处于“已竣工未接收”状态，影响工程的正常使用和效益发挥。
   • 在极端情况下，若因接收手续问题引发法律纠纷，双方可能需通过诉讼或仲裁等方式解决争议，增加解决成本和时间成本。

总结来看，在工程已竣工验收合格但使用单位迟迟不办理接收手续却已实际使用的情况下，责任主体主要涉及发包方和实际使用单位。双方应根据合同约定和相关法律法规，明确各自责任，积极协商解决方案，避免产生不必要的法律纠纷。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。