结论：质保金留存数额的确定，需结合合同约定、实际履行情况及法律规定综合判断，具体分为以下两种情形：

1. 合同有明确约定时，以合同约定为准

• 法律依据：根据《民法典》第465条，依法成立的合同受法律保护，对当事人具有法律约束力。若合同中明确约定“质保金按合同总价款的比例留存”（如合同总价100万元，约定留存5%即5万元），则无论最终结算价是否调整，均应按合同约定执行。
• 例外情形：若合同中同时约定“最终结算价调整后，质保金按调整后金额重新计算”，则需以最终支付数为准。但此类条款需明确具体，否则可能因约定不明被认定为按合同原价留存。

2. 合同无约定或约定不明时，以最终支付数为准

• 法律逻辑：质保金的本质是担保义务履行，其金额应与实际履行的合同标的额挂钩。若合同未明确约定留存基数，或约定“按实际结算价留存”，则应以最终支付的工程款、货款等实际金额为基数计算质保金（如最终结算价为95万元，按5%留存则为4.75万元）。
• 司法实践：法院在审理类似纠纷时，通常会结合合同履行情况、行业惯例及公平原则，倾向于以实际结算价作为质保金计算基数，以避免因合同价与实际价差异导致权利义务失衡。

实务建议

1. 审查合同条款：签订合同时，应明确约定质保金的留存基数（合同价或最终结算价）、比例及返还条件，避免歧义。
2. 保留结算证据：若涉及最终结算价调整，需留存双方确认的结算文件、付款凭证等证据，以证明质保金计算依据。
3. 协商补充协议：若合同未约定或约定不明，双方可协商签订补充协议，明确质保金留存规则，减少纠纷风险。

提示：若您遇到具体合同纠纷，可提供合同文本及履行细节，我将进一步为您分析法律风险及应对策略。