在处理被告提供的旧土地经营权证与原告方提供的新土地经营权证矛盾的情况时，法院会依据相关法律法规和证据规则进行综合判断，以确定哪份证据更具法律效力，并据此作出裁决。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、证据效力的判断
时间先后原则：
- 通常情况下，新颁发的土地经营权证会覆盖或替代旧证，尤其是在土地权属、面积、用途等关键信息发生变更时。因此，法院可能会优先考虑新土地经营权证的效力。
- 但若旧证能证明在特定时间点原告或被告对土地享有某种权利，且该权利未被新证明确剥夺或变更，则旧证仍可能具有部分效力。
证据的真实性与合法性：
- 法院会审查两份土地经营权证的颁发程序是否合法，包括是否经过法定程序审批、是否符合相关法律法规的规定等。
- 同时，法院会核实证据的真实性，如通过比对档案记录、询问相关人员等方式，以确定哪份证据更可信。
证据的关联性：
- 法院会考虑两份证据与案件事实的关联性。如果新证更能直接证明案件事实，如土地的实际使用情况、权属变更等，则法院可能更倾向于采纳新证。
二、法院的处理方式
要求补充证据：
- 如果法院认为仅凭两份土地经营权证难以作出准确判断，可能会要求双方补充其他相关证据，如土地使用协议、缴费凭证、政府批文等。
进行现场勘查：
- 在必要时，法院可能会组织双方进行现场勘查，以直观了解土地的实际使用情况和权属状况。
委托专业机构鉴定：
- 如果涉及土地权属、面积等专业技术问题，法院可能会委托专业机构进行鉴定，以获取更准确的证据。
作出裁决：
- 在综合审查所有证据后，法院会依据相关法律法规和证据规则，作出裁决。裁决可能包括确认土地经营权归属、驳回一方诉讼请求等。
三、法律建议
对于原告：
- 应确保提供的新土地经营权证真实、合法，并尽可能提供其他相关证据以支持其主张。
- 如果认为被告提供的旧证存在虚假或违法情况，应及时向法院提出异议，并要求法院进行审查。
对于被告：
- 如果认为新证存在错误或违法情况，应及时向法院提出反驳意见，并提供旧证及其他相关证据以支持其主张。
- 应积极配合法院的调查和审查工作，提供必要的协助和说明。
在实际操作中，法院会严格遵循法定程序，确保裁决的公正性和合法性。因此，无论是原告还是被告，都应积极准备证据，配合法院工作，以维护自己的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。