在原告证据不足但对方同意赔偿的情况下，其法律依据主要基于双方当事人的自愿处分原则及民事诉讼中的调解制度。以下是对此问题的详细分析：
一、自愿处分原则
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人有权在法律规定的范围内处分自己的民事权利和诉讼权利。这意味着，如果双方当事人自愿达成赔偿协议，即使原告的证据不足，法院也会尊重双方的意愿，并据此作出调解或判决。
实践应用：
- 在实际诉讼中，如果原告证据不足，但被告出于各种原因（如避免诉讼风险、维护商业关系等）愿意赔偿，双方可以协商并达成赔偿协议。这种协议一旦达成，即具有法律效力，双方应遵守执行。
二、民事诉讼中的调解制度
法律依据：
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第九十三条规定：“人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。”这表明，调解是民事诉讼中的一项重要制度，旨在通过双方当事人的协商，达成和解协议，从而解决纠纷。
调解过程：
- 在调解过程中，法院会组织双方当事人进行协商，就赔偿金额、支付方式等事项达成一致意见。如果原告证据不足，但被告愿意赔偿，法院会鼓励双方通过调解解决纠纷，以节省诉讼成本和时间。
调解效力：
- 调解协议一旦达成，即具有与判决书同等的法律效力。双方当事人应按照调解协议的内容履行各自的义务。如果一方不履行调解协议，另一方可以向法院申请强制执行。
三、可能存在的风险与注意事项
证据保留：
- 尽管双方达成了赔偿协议，但原告仍应尽可能保留与案件相关的证据。这是因为，如果后续出现纠纷（如被告不履行赔偿协议），原告需要依靠这些证据来维护自己的权益。
协议内容明确：
- 在达成赔偿协议时，双方应明确协议的内容，包括赔偿金额、支付方式、支付时间等。这有助于避免后续因协议内容不明确而产生的纠纷。
法律程序合规：
- 双方达成的赔偿协议应符合法律程序的要求。例如，协议应经过法院的确认或制作成调解书，以确保其法律效力。
针对您的情况，如果原告证据不足但对方同意赔偿，建议您与对方签订书面的赔偿协议，并明确协议的内容和法律程序。如有需要，可以向我进一步咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。