企业已经通过会议决策而没有正式发文的制度，其有效性需分情况讨论，具体如下：

1. 制度内容合法且程序合规时，具有法律效力

根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，企业内部的规章制度，包括通过会议决策形成的制度，只要其内容不违反法律、行政法规的强制性规定，且制定程序符合公司章程或相关法律法规的要求（如经过职工代表大会或全体职工讨论、协商等），即使没有正式发文，也应当被视为有效。这是因为，法律并未明确规定企业制度必须以正式文件的形式发布才具有法律效力，关键在于制度的内容和制定程序是否合法合规。

1. 制度内容违法或程序不合规时，不具有法律效力

如果企业通过会议决策形成的制度内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者制定程序不符合公司章程或相关法律法规的要求（如未经职工代表大会或全体职工讨论、协商等），那么该制度即使已经通过会议决策，也不具有法律效力。在这种情况下，企业应当及时修改或废止该制度，以避免因制度违法而引发的法律风险。

1. 制度未正式发文可能影响其执行力和公示性

虽然制度的内容和制定程序合法合规是其具有法律效力的前提，但正式发文也是制度执行和公示的重要环节。未正式发文的制度可能在执行过程中遇到障碍，如员工对制度内容不了解、不认可等。因此，为了确保制度的顺利执行和公示性，企业最好还是将通过会议决策形成的制度以正式文件的形式发布，并明确告知全体员工。

法律建议：

• 完善制度制定程序：企业在制定内部规章制度时，应当确保制定程序合法合规，包括经过职工代表大会或全体职工讨论、协商等，以确保制度的合法性和有效性。
• 正式发文并公示：为了确保制度的执行力和公示性，企业最好将通过会议决策形成的制度以正式文件的形式发布，并通过适当的方式（如内部公告、员工手册等）告知全体员工。
• 定期审查和更新制度：企业应当定期对内部规章制度进行审查和更新，以确保其内容始终符合法律法规的要求和企业的实际情况。

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