公司使用员工个人卡分别用于报销和收取未开票款的行为，均存在法律风险，不合法合规。以下从两个行为分别进行详细分析：

一、使用员工个人卡用于报销

1. 税务风险：根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关规定，企业应建立规范的财务制度，使用对公账户进行资金往来，以确保税务申报和缴纳的准确性和透明度。使用员工个人卡进行报销，可能导致企业财务数据不真实、不完整，影响税务申报的准确性，进而引发税务风险，如被税务机关认定为偷税、漏税等违法行为，面临罚款、滞纳金等处罚。
2. 财务管理风险：个人卡的使用缺乏有效的内部控制和审计机制，容易滋生财务舞弊行为，如虚报费用、挪用资金等。这不仅损害企业的利益，还可能影响企业的声誉和信誉。
3. 合规性风险：从合规性角度来看，企业使用员工个人卡进行报销违反了财务管理的基本原则和规定，可能面临监管机构的处罚和整改要求。

二、使用员工个人卡收取未开票款

1. 税务违法风险：根据《中华人民共和国发票管理办法》的规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。使用员工个人卡收取未开票款，属于未按规定开具发票的行为，可能面临税务机关的处罚，如罚款、没收违法所得等。
2. 资金安全风险：个人卡并非企业账户，其资金安全无法得到有效保障。一旦发生资金被盗刷、诈骗等情况，企业将难以追回损失，且可能因无法提供有效证据而面临法律纠纷。
3. 法律责任风险：如果企业使用员工个人卡收取未开票款的行为被认定为偷税、逃税等违法行为，企业及其相关责任人员可能面临刑事责任追究，如有期徒刑、罚金等。

建议：企业应严格遵守相关法律法规和财务管理规定，建立规范的财务制度和内部控制机制，使用对公账户进行资金往来和报销管理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。