农业有毒有害津贴岗位不符，一般不能直接认定为违纪，但具体情况需结合单位规章制度和实际情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 从劳动法规角度

• 岗位匹配性：劳动法规主要关注劳动合同的签订、履行、变更和解除等方面，对于农业有毒有害津贴岗位的具体匹配性，并未有直接规定。但劳动合同中通常会明确岗位性质、工作内容等，若单位以岗位不符为由进行违纪处理，需确保该处理与劳动合同约定相符。
• 津贴发放依据：农业有毒有害津贴的发放通常基于岗位性质、工作环境等因素。若员工实际岗位与申报津贴的岗位不符，单位有权调整津贴发放，但这并不直接等同于违纪处理。

2. 从单位规章制度角度

• 规章制度内容：单位内部规章制度可能对岗位匹配性、津贴发放等有具体规定。若规章制度明确规定了岗位不符的处理方式，且该规定不违反法律法规，则单位可依据规章制度进行处理。
• 规章制度合法性：单位规章制度需经过民主程序制定，并公示或告知员工。若规章制度未经过合法程序制定或未告知员工，则不能作为处理员工的依据。

3. 从实际操作角度

• 沟通协商：若发现岗位不符，单位应首先与员工进行沟通协商，了解原因并寻求解决方案。直接认定为违纪可能引发劳动争议。
• 证据收集：若单位决定进行违纪处理，需收集充分证据证明员工岗位不符，且该不符行为违反了单位规章制度或劳动合同约定。

4. 可能的法律后果

• 劳动争议：若单位未经合法程序或未充分沟通协商即进行违纪处理，员工可能提起劳动争议仲裁或诉讼，要求撤销处理决定或赔偿损失。
• 行政处罚：若单位规章制度违反法律法规，可能面临劳动行政部门的处罚。

建议

• 对于员工：若发现岗位不符或津贴发放有问题，应及时与单位沟通协商，了解原因并寻求解决方案。若认为单位处理不当，可依法维护自身权益。
• 对于单位：应完善规章制度，明确岗位匹配性和津贴发放标准。在处理岗位不符问题时，应确保程序合法、证据充分，并尽量与员工沟通协商解决。

若您在此方面遇到具体问题，可直接向我咨询，我会根据您的实际情况提供更详细的法律建议。