核心结论：村民占用集体土地种树超过20年，需根据土地性质、占用行为合法性及是否符合规划等情况，通过协商、行政处理或法律诉讼等途径解决。以下是具体分析：

1. 土地性质与权属确认

• 集体土地所有权：根据《土地管理法》，农村土地属于集体所有，村民仅享有承包经营权或使用权。若村民未经合法程序（如承包、流转）占用集体土地种树，可能构成侵权。
• 核实权属：首先需通过村委会或国土部门确认土地权属，明确是否为集体所有，以及占用行为是否经过合法审批。

2. 占用行为的合法性分析

• 合法占用：若村民通过承包合同、流转协议等合法方式取得土地使用权，且合同未到期，则其种树行为合法，集体无权要求返还土地。
• 非法占用：若村民无合法依据占用土地，即使超过20年，集体仍有权要求返还土地或补偿损失。但需注意，长期占用可能形成“事实上的管理状态”，需结合具体证据判断。

3. 超过20年的法律效果

• 诉讼时效：根据《民法典》，请求返还财产的诉讼时效为3年，但若占用行为持续存在，时效可能从知道或应当知道权利受损之日起计算。超过20年并不直接导致权利丧失，但需证明集体曾主张权利或占用行为违法。
• 行政处理优先：对于土地纠纷，建议先通过乡镇政府或国土部门调解、处理，效率更高。若行政途径无效，再考虑法律诉讼。

4. 解决方案建议

• 协商解决：集体可与村民协商，通过补偿、调整土地等方式达成和解。
• 行政处理：向乡镇政府或国土部门申请调解，要求村民返还土地或补办手续。
• 法律诉讼：若协商、行政处理无效，集体可向法院起诉，要求返还土地、赔偿损失或确认占用行为违法。

5. 特殊情形：历史遗留问题

• 政策因素：若占用行为发生在特定历史时期（如改革开放初期），可能受当时政策影响，需结合地方政策处理。
• 证据收集：集体需提供土地权属证明、占用行为证据（如照片、证人证言）等，以支持主张。

总结：村民占用集体土地种树超过20年，需根据土地权属、占用合法性及证据情况，通过协商、行政处理或法律诉讼解决。建议集体先核实土地权属，再选择合适途径维护权益。如有具体问题，可直接向我咨询。