核心结论：针对您在农村的土地被他人种树20多年的情况，您有权要求对方停止侵害、恢复原状或赔偿损失，具体可通过协商、调解或诉讼等途径解决。以下从不同角度为您详细分析：

1. 土地权属与侵权认定
   根据《民法典》第240条，您作为土地承包经营权人或所有权人，对土地享有占有、使用、收益的权利。他人未经您同意在您土地上种树，构成对土地使用权的侵害，属于侵权行为。即使对方种树时间长达20年，不因时间推移而自动取得土地使用权或树木所有权，您仍有权主张权利。

2. 解决途径与程序建议

   • 协商与调解：首先可尝试与对方沟通，要求其移除树木、恢复土地原状，或协商补偿方案（如您允许对方保留树木并支付租金）。若协商不成，可申请村委会、乡镇司法所或人民调解委员会介入调解，形成书面调解协议。
     
   • 行政投诉：若对方拒绝配合，可向当地自然资源部门（原国土局）或农业农村部门举报，要求查处非法占用土地行为。
     
   • 民事诉讼：若上述途径无效，您可直接向法院起诉，主张侵权责任（停止侵害、排除妨碍、赔偿损失）。根据《民法典》第1165条，您需提供土地权属证明（如承包合同、土地证）及对方侵权的证据（如照片、证人证言）。

3. 关键证据与注意事项

   • 证据收集：尽快固定证据，包括土地权属文件、现场照片、视频、证人证言等。若树木已成材，可申请司法鉴定评估损失（如土地收益减少、树木价值等）。
     
   • 诉讼时效：根据《民法典》第188条，诉讼时效为3年，自您知道或应当知道权利受损之日起计算。但若对方持续侵权（如树木未移除），诉讼时效从侵权行为终止之日起算，因此您仍可主张权利。
     
   • 树木处理：若您要求移除树木，需注意树木可能属于对方财产，您可主张对方自行移除并恢复原状；若您同意保留树木，可要求对方支付土地占用费或树木收益分成。

4. 特殊情形提示

   • 若对方主张“善意占有”（如误以为土地为其所有），需提供证据证明其无过错，否则仍需承担侵权责任。
     
   • 若土地存在权属争议（如您与他人共有或未确权），需先通过行政确权程序明确权属，再主张侵权责任。

行动建议：建议您优先通过协商或调解解决，若对方态度强硬，可委托律师起草律师函或直接起诉。如有进一步疑问或需要协助收集证据、起草法律文书，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供详细方案。