两违行为（即违法用地和违法建设行为）的处罚部门，主要取决于具体的行为性质和地区管理方式，但通常由“两违办”或相关职能部门进行处罚。以下是对此问题的详细分析：
一、“两违办”的处罚职责
“两违办”的性质：
- “两违办”，即违法用地、违法建设综合整治办公室，是地方政府为整治违法用地和违法建设而设立的临时性协调机构。
- 它并非一个独立的、法定的传统政府部门，而是由地方政府根据实际需要设立，通常挂靠在当地城市管理部门或自然资源部门下运作。
“两违办”的处罚功能：
- “两违办”负责统筹、协调和指导辖区内对违法用地和违法建设行为的查处工作。
- 在查处过程中，“两违办”不仅会对违法行为进行处罚，还会通过宣传教育等方式，提高公众对土地管理和城市建设法规的认识。
二、相关职能部门的处罚职责
城市管理部门：
- 城市管理部门（如城管局）通常负责城市市容市貌的管理，包括对违法建设的查处。
- 在“两违办”未设立或未直接参与的情况下，城市管理部门可能单独承担对违法建设的处罚职责。
自然资源部门：
- 自然资源部门（如国土资源局）负责土地资源的规划、管理和保护，包括对违法用地的查处。
- 对于涉及土地违法的行为，自然资源部门将依法进行处罚。
其他相关部门：
- 根据地区差异和具体行为性质，住建局、公安局等部门也可能参与对“两违”行为的处罚工作。
- 例如，住建局可能负责建筑市场的监管，对违法建设行为进行处罚；公安局则可能负责维护社会治安，对阻碍执法等行为进行处罚。
三、地区差异与咨询建议
- 需要注意的是，“两违办”的具体归属和管理方式在不同地区可能有所不同。有些地区可能由“两违办”直接负责处罚，而有些地区则可能由相关职能部门单独或联合进行处罚。
- 如果您需要更具体的信息或帮助，建议直接咨询当地政府相关部门（如城市管理局、自然资源局等）或向我咨询，以获取针对您所在地区的准确解答和指导。
四、法律后果与建议
- 对于“两违”行为，相关部门将依法进行处罚，包括罚款、拆除违法建筑、恢复土地原状等。
- 为了避免不必要的法律后果，建议您遵守土地管理和城市建设法规，不进行违法用地和违法建设行为。如果发现身边存在“两违”行为，也可以向相关部门举报，共同维护良好的城市环境和土地管理秩序。