结论前置：工厂员工旷离时，工资的扣除并非固定标准，而是主要依据劳动合同、用人单位的规章制度以及实际造成的损失来确定。具体来说，旷工期间不计算工资，但已正常工作的天数应支付相应工资；若因旷离给工厂造成损失，工厂可要求赔偿，但赔偿金额需合理且不能直接克扣全部工资。
一、工资支付原则与旷工期间工资处理
实际工作天数计算工资：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠。因此，对于员工正常出勤并提供劳动的天数，工厂应按照劳动合同约定的工资标准和实际出勤天数支付工资。
- 示例：若员工月工资为5000元，实际出勤20天，则应支付工资为\(5000元 \div 30天 \times 20天 \approx 3333.33元\)（假设一个月按30天计算，实际计算时可根据具体月份天数调整）。
旷工期间不计算工资：
- 员工旷工期间，即未按照用人单位规定提供劳动且无正当理由的缺勤期间，是不计算工资的。这是基于劳动者未履行其劳动义务的事实。
二、旷离给工厂造成损失时的工资处理
损失赔偿原则：
- 如果员工的旷离行为给工厂造成了实际损失，如生产停滞、订单延误等，根据《中华人民共和国劳动合同法》第九十条，工厂可以依据合法有效的规章制度要求员工承担赔偿责任。
- 赔偿金额限制：赔偿金额需根据实际损失来确定，且用人单位需承担举证责任，证明损失的存在和具体数额。同时，赔偿金额不能直接作为克扣或拒发员工全部工资的理由。
工资扣除的合法性：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 示例：若员工月工资为5000元，因旷离给工厂造成损失1000元，且工厂规章制度规定可从工资中扣除赔偿，则每月最多可扣除\(5000元 \times 20\% = 1000元\)中的合理部分（如实际损失1000元，且扣除后工资不低于最低工资标准，则可全额扣除1000元中的合理赔偿额，但需注意若损失超过当月工资20%的部分，需通过其他方式追偿或协商解决）。
三、实际操作建议与争议解决
对于劳动者：
- 在离职前应与用人单位妥善协商处理相关事宜，确保自己的权益不受损害。
- 若认为扣款不合理，应及时提出异议并寻求法律途径解决，如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于用人单位：
- 在制定规章制度时应明确旷工离职的扣款标准，并确保这些规定的合法性、合理性和透明度。
- 在执行扣款时，应严格遵守法律规定，避免引发不必要的纠纷。
争议解决途径：
- 双方应首先尝试协商解决争议。
- 若协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总结：工厂员工旷离时，工资的扣除并非固定标准，而是需根据劳动合同、用人单位的规章制度以及实际造成的损失来确定。劳动者和用人单位都应充分了解相关法律法规和规章制度，以确保自身权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。