当您遇到申请工伤但老板不愿配合的情况时，您完全有权自行提出工伤认定申请来维护自己的合法权益。

首先，根据《工伤保险条例》第十七条的规定，如果用人单位没有按照相关规定为您提出工伤认定申请，那么您作为工伤职工，或者您的近亲属、工会组织，在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地的统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

其次，需要明确的是，根据《关于实施〈工伤保险条例〉若干问题的意见》的相关规定，用人单位是否同意（签字、盖章）并不是提出工伤认定申请的必经程序。这意味着，即使您的老板不愿意配合，您仍然可以自行提出申请，无需得到他的同意或签字。

在具体操作时，您需要准备相关的证明材料，如医疗证明、事故报告等，以证明您确实遭受了工伤。然后，您可以前往当地的社会保险行政部门，提交工伤认定申请，并按照要求填写相关表格和提供所需材料。

最后，我想强调的是，维护自己的合法权益是非常重要的。如果您遇到了老板不愿配合申请工伤的情况，不要放弃，要勇敢地站出来，通过法律途径来维护自己的权益。同时，也可以寻求工会组织或法律援助机构的帮助，以更好地解决问题。