不能仅因公司原因就直接认定为劳动者不能胜任工作。这一认定需要基于具体的事实和证据，并遵循一定的法律程序和标准。以下从多个角度进行分析：
一、法律定义与标准
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，不能胜任工作通常指的是劳动者在劳动合同约定的岗位上，无法按照用人单位的要求完成工作任务，或者其工作能力、工作成果明显低于同岗位的平均水平。这一认定并非单纯基于公司的主观判断，而是需要客观、公正的评估。
二、公司原因与不能胜任工作的关系
公司原因导致工作条件变化：如果公司因经营策略调整、组织架构变动等原因，导致劳动者的工作内容、工作条件发生显著变化，且这种变化超出了劳动者原有的能力范围或合同约定，那么不能直接将劳动者认定为不能胜任工作。此时，公司应与劳动者协商，根据实际情况调整工作岗位或提供必要的培训。
公司原因导致劳动者能力下降：如果公司因管理不善、工作环境恶劣等原因，导致劳动者的工作能力下降，同样不能直接将劳动者认定为不能胜任工作。公司应首先改善工作环境、提供必要的支持，帮助劳动者恢复工作能力。
三、认定不能胜任工作的程序
明确考核标准：公司应事先制定明确、具体、可量化的考核标准，并告知劳动者。这些标准应与劳动合同约定的岗位责任、工作要求相一致。
公正考核过程：公司应按照既定的考核标准，对劳动者进行公正、客观的考核。考核过程应透明、公开，允许劳动者提出异议。
提供改进机会：如果劳动者在考核中未能达到标准，公司应首先与劳动者沟通，分析原因，提供必要的培训或调整工作岗位的机会，帮助劳动者提升工作能力。
合法解除劳动合同：只有在经过上述步骤后，劳动者仍然无法胜任工作，且公司无法为其提供其他合适的工作岗位时，公司才能依据《劳动合同法》的相关规定，合法解除劳动合同。
四、法律后果与建议
违法解除的法律后果：如果公司未经上述程序，仅因公司原因就擅自认定劳动者不能胜任工作并解除劳动合同，可能构成违法解除。此时，劳动者有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
建议：对于公司而言，应建立健全的考核机制，确保考核过程的公正、客观；对于劳动者而言，应了解自己的权利和义务，积极与公司沟通，维护自己的合法权益。如果遇到类似问题，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的权益。
综上所述，不能仅因公司原因就直接认定为劳动者不能胜任工作。这一认定需要基于具体的事实和证据，并遵循一定的法律程序和标准。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。