抵押权并非善意取得时，可以确认其无效，但需根据具体情况进行判断。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、善意取得的基本构成与抵押权无效的情形
善意取得是物权法中的一项重要制度，它要求受让人在取得物权时，必须出于善意、支付合理对价，并且完成法定的公示程序（如登记）。在抵押权领域，若抵押权人并非善意取得，即其取得抵押权时存在恶意、未支付合理对价或未完成法定公示程序等情形，那么该抵押权可能面临被确认无效的风险。
恶意取得：若抵押权人明知抵押物存在权利瑕疵或抵押人无权处分，仍接受抵押，则构成恶意取得。在此情况下，抵押权因缺乏善意要件而可能被确认无效。
未支付合理对价：虽然抵押权的设立通常不涉及对价的直接支付，但若抵押权人与抵押人之间存在其他经济往来，且抵押权的设立与该经济往来存在不合理关联（如抵押权人未支付合理对价即取得抵押权），则可能影响抵押权的效力。不过，这一情形在抵押权领域相对少见，更多见于其他物权变动场景。
未完成法定公示程序：抵押权的设立需依法进行登记。若抵押权人未完成登记手续，则抵押权未设立，自然不存在善意取得的问题。但若已登记，则需进一步审查是否满足善意取得的其他要件。
二、抵押权无效的确认程序与法律依据
当抵押权并非善意取得时，相关权利人（如抵押物的真正所有权人）可以通过法律途径确认抵押权无效。这通常涉及以下步骤：
提起诉讼：权利人需向法院提起诉讼，请求确认抵押权无效。在诉讼过程中，权利人需提供证据证明抵押权人并非善意取得。
法院审查：法院将审查权利人提供的证据，包括抵押合同的签订过程、抵押权人的主观状态、是否支付合理对价以及是否完成法定公示程序等。
判决与执行：若法院认定抵押权并非善意取得，将判决确认抵押权无效。判决生效后，权利人可申请法院执行，恢复抵押物的原始状态。
法律依据：主要依据《中华人民共和国民法典》中关于物权变动、善意取得以及抵押权设立的相关规定。例如，《民法典》第三百一十一条规定了善意取得的构成要件，第三百九十四条至第四百零二条则规定了抵押权的设立、效力及消灭等事项。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：权利人在提起诉讼前，应充分收集证据，包括抵押合同的原件、抵押权人的主观状态证明（如聊天记录、邮件等）、是否支付合理对价的证据以及抵押登记情况等。
法律程序：权利人应严格按照法律程序提起诉讼，确保诉讼的合法性和有效性。在诉讼过程中，应积极配合法院的调查和审理工作。
风险评估：在提起诉讼前，权利人应对诉讼风险进行评估，包括诉讼成本、诉讼周期以及可能面临的法律后果等。若风险较大，可考虑通过协商、调解等方式解决争议。
总结：抵押权并非善意取得时，可以确认其无效。但需根据具体情况进行判断，并严格按照法律程序进行操作。若您在此方面遇到法律问题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。