针对您提出的“合同约定加班费按最低工资标准计算合法吗”这一问题，以下是我的详细解答：

结论前置：合同约定按最低工资标准支付加班费，在多数情况下是不合法的，因为这往往违反了加班费计算的法定标准，可能侵害劳动者的合法权益。

详细分析：

1. 加班费的法定计算标准：

   • 根据《劳动法》及相关法律法规，加班费的计算应基于劳动者的正常工作时间工资，而非最低工资标准。
   • 具体来说，延长工作时间需支付不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%作为加班费；休息日工作且不能安排补休的，需支付不低于200%的加班费；法定休假节日工作的，需支付不低于300%的加班费。

2. 加班费计算基数的确定：

   • 如果劳动合同中明确约定了工资数额，应以该约定的工资作为加班费的计算基数。若工资项目分为多项，如“基本工资”、“岗位工资”等，则应以各项工资的总和作为基数。
   • 如果劳动合同没有明确约定工资数额或约定不明确，则应以实际工资作为加班费的计算基数，这包括用人单位直接支付给劳动者的所有收入，但不得低于当地最低工资标准。

3. 最低工资标准与加班费的关系：

   • 最低工资标准是劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。它并非计算加班费的基数。
   • 仅以最低工资标准作为计算加班费的基数，往往会导致劳动者实际获得的加班费低于法定标准，从而侵害劳动者的合法权益。

4. 合法与不合法的情形：

   • 合法情形：若劳动合同中明确约定加班费计算基数为最低工资标准，且该约定是双方平等自愿、协商一致的结果，同时不违反法律强制性规定（即按照最低工资标准计算出的加班费不低于法定最低加班费数额），且未导致显失公平，则这种约定可能是合法的。但这种情况在实际操作中较为罕见。
   • 不合法情形：如果以最低工资标准为基数计算出的加班费低于以正常工作时间工资为基数计算得出的法定最低加班费数额，或者该约定违反了法律强制性规定、显失公平，则这种约定是不合法的。

实际操作建议：

• 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于加班费计算的部分，确保自己的权益得到保障。
• 如果发现用人单位存在以最低工资标准作为加班费计算基数的违法行为，劳动者有权要求用人单位按照法定标准支付加班费。
• 若用人单位拒绝支付或支付不足，劳动者可以通过法律途径来维护自己的合法权益，如向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

综上所述，合同约定按最低工资标准支付加班费在多数情况下是不合法的。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取法律措施来维护自己的合法权益。