迟到说不影响绩效的情况下，一般不应扣工资，但具体是否扣工资还需结合用人单位的规章制度和劳动合同的约定来判断。以下是对此问题的详细分析：

一、规章制度与劳动合同的约定

1. 规章制度明确规定：

   • 如果用人单位的规章制度中明确规定了迟到与工资扣减的关系，并且该规章制度已经通过民主程序制定（如经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定），且已向劳动者公示或告知，那么该规章制度对劳动者具有约束力。但在此问题中，已明确提到“迟到说不影响绩效”，若此说法出自规章制度，则用人单位不应因迟到而扣减绩效工资。

2. 劳动合同有相关约定：

   • 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了迟到不影响绩效工资，那么用人单位应遵守该约定，不得随意扣减。

二、合法扣除工资的情况

• 即便规章制度或劳动合同中有关于迟到与工资扣减的约定，也需确保扣减的幅度合理，不得损害劳动者的基本权益。例如，扣除的部分通常不得超过劳动者当月工资的20%（具体比例可能因地区而异，需参照当地劳动法规）。但在此问题中，由于已明确“不影响绩效”，因此这一限制条件在此场景下不适用。

三、不合法扣除工资的情况

1. 规章制度不合法或未公示：

   • 如果用人单位的规章制度未经民主程序制定，或未向劳动者公示告知，则该规章制度对劳动者不具有约束力。在此情况下，用人单位不得依据该规章制度扣减工资。

2. 无相关约定或规定：

   • 如果规章制度或劳动合同中未明确规定迟到可以扣工资，则用人单位不得随意扣除。在此问题中，由于已明确“不影响绩效”，因此可以视为无相关扣减工资的约定。

3. 扣除幅度不合理：

   • 即便规章制度或劳动合同中有规定，但如果扣减幅度明显不合理，如迟到一次就扣掉当月一半工资，这种过度的扣减可能被认定为不合法。但在此问题中，由于已明确“不影响绩效”，因此这一情况也不适用。

四、员工权益保护

• 如果劳动者认为用人单位扣工资的行为不合法，首先应与用人单位进行沟通协商，要求其说明扣工资的依据和合理性。
• 协商不成时，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

五、综合建议

• 对于劳动者：在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资、绩效、考勤等方面的约定。如果发现用人单位有违法扣减工资的行为，应及时与用人单位沟通或寻求法律援助。
• 对于用人单位：在制定规章制度时，应确保内容合法、程序正当，并充分尊重员工的合法权益。同时，应明确告知员工规章制度的内容，确保员工知晓并遵守。

综上所述，迟到说不影响绩效的情况下，一般不应扣工资。但具体是否扣工资还需结合用人单位的规章制度和劳动合同的约定来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。