结论前置：一般情况下，公司因采购商品有库存而扣员工工资是违法的，但若员工存在故意或重大过失导致库存积压且给公司造成重大损失，公司可依据合法程序要求赔偿，不过也不能直接从工资中扣除。以下从不同角度为你详细分析：

正常离职情况下，公司扣工资违法

根据《工资支付暂行规定》第十五条，用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：

1. 用人单位代扣代缴的个人所得税；
2. 用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
3. 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
4. 法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。

采购商品有库存并不属于上述可以代扣工资的法定情形。所以，在正常离职的情况下，公司以采购商品有库存为由扣工资，是没有法律依据的，属于违法行为。例如，小李是一名采购员，他按照公司的正常采购流程采购了一批商品，后来他提出离职，公司却以这批商品还有库存为由扣了他一部分工资，这种做法就是不合法的。

特殊情况下，公司可要求赔偿但有严格限制

如果员工在采购过程中存在故意或重大过失，导致采购的商品出现大量积压，且给公司造成了重大损失，公司可以依据《工资支付暂行规定》第十六条，要求员工赔偿经济损失。不过，公司要求赔偿也有严格的限制：

1. 赔偿方式：经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
2. 程序要求：公司要求员工赔偿，需要有充分的证据证明员工的故意或重大过失行为，以及该行为与损失之间的因果关系。例如，公司要证明采购员在采购时没有进行合理的市场调研，盲目大量采购，导致商品积压，给公司造成了损失。而且，公司不能自行决定扣除工资，需要与员工协商一致，或者通过劳动仲裁、诉讼等合法途径解决。

假如采购员小张在采购时，没有按照公司的采购计划和市场需求进行采购，而是私自大量采购了一种市场已经饱和的商品，导致这批商品积压，给公司造成了重大经济损失。公司经过调查取证，证明小张存在重大过失，那么公司可以要求小张赔偿损失，但每月扣除工资的比例不能超过当月工资的20%，且扣除后工资不能低于当地最低工资标准。

建议：如果你遇到了公司以采购商品有库存为由扣工资的情况，你可以先与公司协商，要求公司说明扣工资的合法依据。如果协商不成，你可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，欢迎直接向我咨询。