合同甲方后期盖章的合同，其有效性并非绝对，而是取决于多种因素。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同成立与生效的基本条件：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，在一般情况下，合同的成立需要双方当事人的共同意思表示，即双方均需在合同上签字或盖章。

2. 甲方后期盖章的合同效力分析：

   • 若合同已满足成立条件：如果合同在甲方后期盖章之前，已经通过其他方式（如乙方签字、按指印等）满足了成立条件，且合同内容合法、双方意思表示真实，那么甲方后期盖章通常不会影响合同的效力。此时，合同自成立时即生效，甲方盖章只是对合同的一种确认或补充。
   • 若合同未满足成立条件：如果合同在甲方后期盖章之前，尚未满足成立条件（如乙方尚未签字或按指印），那么甲方后期盖章的行为将构成合同成立的关键要素之一。此时，合同自甲方盖章且乙方也完成相应签字或按指印等手续时成立并生效。但需注意，如果乙方最终未签字或按指印，且没有实际履行合同主要义务，那么合同可能因缺乏双方共同意思表示而无效。
   • 特殊情况下的合同效力：
     • 实际履行情况：即使合同在形式上尚未完全成立（如乙方未签字或盖章），但如果乙方已经按照合同中的核心条款履行了主要义务，并且甲方对此表示认可并接受，那么这份合同仍然可以视为已经成立并有效。这是因为双方的实际行为已经表明了他们对合同内容的共识和接受。
     • 法定代表人或授权代表签字：如果合同上虽然没有乙方的盖章，但乙方的法定代表人或经合法授权的代表已经在合同上签字，且甲方后期也进行了盖章，那么这份合同同样可能有效。因为法定代表人或授权代表的签字与盖章具有同等的法律效力，能够表明乙方对合同的认可。

3. 法律建议：

   • 确保合同形式要件完备：为避免因形式要件不符合法律规定而导致合同无效的风险，建议双方在签订合同时确保合同上均有双方的签字或盖章。如果因特殊原因无法同时签字或盖章，也应通过其他方式（如传真、电子邮件等）确认双方的意思表示，并及时补办签字或盖章手续。
   • 注意合同内容的合法性与真实性：除了形式要件外，合同的内容也必须合法、真实，且双方意思表示一致。如果合同内容存在违法或虚假情况，或者一方是在被欺诈、胁迫的情况下签订合同，那么合同可能因意思表示不真实或违法而无效。
   • 及时咨询专业律师：在签订合同或处理合同纠纷时，如果涉及复杂的法律问题或不确定的法律风险，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案，帮助当事人维护自身合法权益。

综上所述，合同甲方后期盖章的合同效力并非绝对有效或无效，而是需要根据具体情况综合判断。在实际操作中，应谨慎处理此类情况，以确保合同的合法性和有效性。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。