结论：公司注销后，公司主体消亡，员工确实不能以公司为诉讼主体进行仲裁或诉讼，但一般情况下也不能直接起诉法定代表人，需根据具体情况确定责任主体并采取相应的法律措施。
一、公司注销后的法律后果
公司注销意味着公司作为独立法人的资格终止，其民事权利能力和民事行为能力随之消灭。因此，员工无法再以公司为诉讼主体进行仲裁或诉讼，因为公司已不存在，无法成为法律上的被诉对象。
二、法定代表人责任分析
法定代表人的一般责任：
- 法定代表人是代表公司行使职权的负责人，其行为通常视为公司行为。然而，在公司注销后，法定代表人个人并不自动承担公司债务或责任，除非存在特定情形。
特定情形下的责任：
- 清算责任：如果公司在注销过程中未依法进行清算，或者清算过程中存在违法行为（如隐匿财产、虚构债务等），导致债权人利益受损，那么清算义务人（包括法定代表人）可能需要承担相应的赔偿责任。
- 个人担保或承诺：如果法定代表人在公司运营过程中以个人名义为公司债务提供担保或作出承诺，那么在公司注销后，债权人可能有权要求法定代表人履行担保责任或承诺。
- 违法行为责任：如果法定代表人在公司运营过程中存在违法行为（如贪污、受贿、挪用资金等），那么即使公司注销，其个人也可能需要承担相应的刑事责任或民事责任。
三、员工应采取的法律措施
确认责任主体：
- 员工应首先确认公司注销的原因和过程，以及是否存在上述特定情形。如果存在，员工应确定责任主体（如清算义务人、担保人等）。
收集证据：
- 员工应收集相关证据，如劳动合同、工资单、公司注销文件、清算报告等，以证明自己的权益和责任主体的存在。
采取法律行动：
- 根据责任主体的不同和证据的充分性，员工可以选择向清算义务人、担保人等主张权利，或者通过法律途径（如诉讼、仲裁等）解决争议。但需要注意的是，直接起诉法定代表人通常不是首选方案，除非存在上述特定情形。
四、建议与注意事项
及时咨询专业律师：
- 由于公司注销后的法律问题复杂且涉及多个方面，员工应及时咨询专业律师以获取准确的法律建议和指导。
注意法律时效：
- 员工应注意法律时效的规定，及时在法定期限内主张自己的权利，避免因超过时效而丧失胜诉权。
保留相关证据：
- 员工应妥善保留与公司注销相关的所有证据和文件，以备不时之需。
作为沈权峰律师，我擅长处理公司法务领域的各类问题。如果您在公司注销、员工权益保护等方面遇到法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。