在出口骗税案件中，虚开发票的公司是否会被认定为主犯，需根据其在共同犯罪中的具体作用和地位来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、主犯的认定标准

根据《中华人民共和国刑法》第二十六条的规定，主犯是指组织、领导犯罪集团进行犯罪活动的或者在共同犯罪中起主要作用的犯罪分子。在出口骗税案件中，若虚开发票的公司不仅实施了虚开发票的行为，还组织、策划、指挥了整个骗税活动，或者在骗税活动中起到了关键作用，如提供虚假出口货物信息、伪造报关单等，那么该公司很可能被认定为主犯。

二、虚开发票公司在共同犯罪中的角色

1. 若仅为虚开发票：

   • 如果虚开发票的公司仅负责虚开发票，而未参与出口骗税的其他环节，如组织货物出口、伪造报关单、骗取退税款等，那么该公司可能被认定为从犯，而非主犯。
   • 在这种情况下，虚开发票的行为虽然违法，但其在整个骗税链条中的作用相对较小，因此可能不会承担主犯的法律责任。

2. 若涉及多个环节：

   • 如果虚开发票的公司不仅虚开发票，还积极参与了出口骗税的其他环节，如与出口企业勾结，提供虚假出口货物信息，伪造报关单等，那么该公司在共同犯罪中的作用将显著增大。
   • 在这种情况下，该公司可能因其在骗税活动中的组织、策划、指挥作用而被认定为主犯。

三、法律后果

1. 主犯的法律后果：

   • 根据《中华人民共和国刑法》的规定，主犯应当按照其所参与的或者组织、指挥的全部犯罪处罚。这意味着，如果虚开发票的公司被认定为主犯，那么它将承担整个骗税活动的法律责任，包括骗取的退税款、罚款以及可能的刑事处罚。

2. 从犯的法律后果：

   • 对于从犯，根据《中华人民共和国刑法》第二十七条的规定，应当从轻、减轻处罚或者免除处罚。这意味着，如果虚开发票的公司被认定为从犯，那么它在法律责任上将相对较轻。

四、实际案例与司法实践

在实际案例中，法院会根据虚开发票公司在共同犯罪中的具体作用和地位来认定其是否为主犯。例如，在某些案件中，虚开发票的公司可能因积极参与骗税活动的多个环节而被认定为主犯；而在另一些案件中，虚开发票的公司可能仅因虚开发票行为而被认定为从犯。

总结与建议：

在出口骗税案件中，虚开发票的公司是否会被认定为主犯，需根据其在共同犯罪中的具体作用和地位来判断。因此，对于涉及出口骗税案件的公司而言，务必严格遵守法律法规，避免参与任何形式的骗税活动。如果公司不幸卷入此类案件，建议及时咨询专业律师，以便更好地了解自身法律责任并寻求合法途径解决问题。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。